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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.368404Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 263 / 3316537 227 / 2498449 4849 / 114162531 5186 / 109592465 263 / 3316537 227 / 2498449 4849 / 114162531 5186 / 109592465
adrenal cortex -- 2 / 9928 -- -- -- 2 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 3 / 16077 5 / 57865 --   3 / 16077 5 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 3 / 14774 9 / 29891 31 / 5047110 42 / 4978364 3 / 14774 9 / 29891 31 / 5047110 42 / 4978364
brain 34 / 506301 16 / 200215 24 / 729526 252 / 4997811 34 / 506301 16 / 200215 24 / 729526 252 / 4997811
cartilage   8 / 37226 -- 35 / 778035 0 / 15965 8 / 37226 -- 35 / 778035
cerebellum 8 / 90353   1 / 90885 44 / 1495938 8 / 90353 0 / 0 1 / 90885 44 / 1495938
cerebrum 23 / 198932   -- -- 23 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   8 / 44577 -- -- 0 / 3888 8 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 10 / 151167 1 / 98089 18 / 643586 1 / 26551 10 / 151167 1 / 98089 18 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 19 / 246043   -- -- 19 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 2 / 19564 1 / 2857 -- -- 2 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 11 / 128826 4 / 46440 2 / 85898 329 / 12434232 11 / 128826 4 / 46440 2 / 85898 329 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803 3 / 12721 2 / 45908 -- 1 / 28803 3 / 12721 2 / 45908 --
heart 5 / 76442   2 / 83063 -- 5 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney 7 / 106627 15 / 89898 9 / 155372 5 / 100281 7 / 106627 15 / 89898 9 / 155372 5 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 1 / 96846 12 / 107249 1 / 66308 6 / 214987 1 / 96846 12 / 107249 1 / 66308 6 / 214987
lung 14 / 128150 17 / 170663 11 / 159917 5 / 159059 14 / 128150 17 / 170663 11 / 159917 5 / 159059
lymph node 2 / 62650 3 / 27007 107 / 5278419 21 / 4863489 2 / 62650 3 / 27007 107 / 5278419 21 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 6 / 46553 8 / 104307 818 / 43166038 2578 / 30312656 6 / 46553 8 / 104307 818 / 43166038 2578 / 30312656
muscle 3 / 74039 1 / 27691   3 / 61270 3 / 74039 1 / 27691 0 / 107836 3 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   3 / 89988 8 / 94887 5 / 179472 0 / 11462 3 / 89988 8 / 94887 5 / 179472
pancreas       5 / 189999 0 / 7237 0 / 74930 0 / 85728 5 / 189999
pancreatic islet 13 / 96524   -- -- 13 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 33 / 241088 2 / 39531 29 / 207348 -- 33 / 241088 2 / 39531 29 / 207348 --
pooled tissue 19 / 276455   -- -- 19 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 4 / 79993 9 / 107080 11 / 266949 18 / 491794 4 / 79993 9 / 107080 11 / 266949 18 / 491794
retina   -- 34 / 820326 1 / 88490 0 / 29438 -- 34 / 820326 1 / 88490
salivary gland   1 / 10368 -- -- 0 / 2490 1 / 10368 -- --
skin 9 / 73633 3 / 125377 942 / 26905847 1396 / 34522313 9 / 73633 3 / 125377 942 / 26905847 1396 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 3 / 52939   -- -- 3 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 214 / 6230144 -- -- -- 214 / 6230144 --
stomach 3 / 26641 4 / 65644 6 / 124767 17 / 448716 3 / 26641 4 / 65644 6 / 124767 17 / 448716
synovium   1 / 1650 -- -- 0 / 249 1 / 1650 -- --
testis 13 / 143630 31 / 100058 -- 397 / 12372003 13 / 143630 31 / 100058 -- 397 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   4 / 32606 5 / 115938 6 / 124664 0 / 11737 4 / 32606 5 / 115938 6 / 124664
uncharacterized tissue 11 / 207932 39 / 479819   3 / 51729 11 / 207932 39 / 479819 0 / 21833 3 / 51729
uterus 4 / 38063 7 / 133582 464 / 10193077 -- 4 / 38063 7 / 133582 464 / 10193077 --
vascular 4 / 46250 -- 2116 / 13135050 -- 4 / 46250 -- 2116 / 13135050 --
white blood cells -- -- 11 / 846268 -- -- -- 11 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --