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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.356624Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 275 / 3316537 176 / 2498449 1885 / 114162531 2402 / 109592465 275 / 3316537 176 / 2498449 1885 / 114162531 2402 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077 9 / 57865 -- 1 / 83577 2 / 16077 9 / 57865 -- 1 / 83577
bone marrow 1 / 14774   3 / 5047110   1 / 14774 0 / 29891 3 / 5047110 0 / 4978364
brain 12 / 506301 15 / 200215 8 / 729526 69 / 4997811 12 / 506301 15 / 200215 8 / 729526 69 / 4997811
cartilage   7 / 37226 -- 14 / 778035 0 / 15965 7 / 37226 -- 14 / 778035
cerebellum 1 / 90353     29 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 0 / 90885 29 / 1495938
cerebrum 2 / 198932 1 / 3422 -- -- 2 / 198932 1 / 3422 -- --
cervix   1 / 44577 -- -- 0 / 3888 1 / 44577 -- --
colon   3 / 151167   2 / 643586 0 / 26551 3 / 151167 0 / 98089 2 / 643586
ear 11 / 16130 -- -- -- 11 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 22 / 246043   -- -- 22 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 2 / 19564   -- -- 2 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 17 / 128826   1 / 85898 131 / 12434232 17 / 128826 0 / 46440 1 / 85898 131 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803   1 / 45908 -- 1 / 28803 0 / 12721 1 / 45908 --
heart 27 / 76442   2 / 83063 -- 27 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney 5 / 106627 3 / 89898 1 / 155372   5 / 106627 3 / 89898 1 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 7 / 96846 3 / 107249 1 / 66308 1 / 214987 7 / 96846 3 / 107249 1 / 66308 1 / 214987
lung 23 / 128150 3 / 170663 1 / 159917   23 / 128150 3 / 170663 1 / 159917 0 / 159059
lymph node   1 / 27007 5 / 5278419   0 / 62650 1 / 27007 5 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 1 / 46553 4 / 104307 298 / 43166038 502 / 30312656 1 / 46553 4 / 104307 298 / 43166038 502 / 30312656
muscle 5 / 74039 2 / 27691   2 / 61270 5 / 74039 2 / 27691 0 / 107836 2 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary     3 / 94887 3 / 179472 0 / 11462 0 / 89988 3 / 94887 3 / 179472
pancreas 1 / 7237 87 / 74930 1 / 85728 3 / 189999 1 / 7237 87 / 74930 1 / 85728 3 / 189999
pancreatic islet 3 / 96524 4 / 30072 -- -- 3 / 96524 4 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system 4 / 14891   -- -- 4 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 51 / 241088 2 / 39531 6 / 207348 -- 51 / 241088 2 / 39531 6 / 207348 --
pooled tissue 25 / 276455   -- -- 25 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 5 / 79993   2 / 266949   5 / 79993 0 / 107080 2 / 266949 0 / 491794
retina   --   3 / 88490 0 / 29438 -- 0 / 820326 3 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 9 / 73633 1 / 125377 247 / 26905847 1370 / 34522313 9 / 73633 1 / 125377 247 / 26905847 1370 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 6 / 52939   -- -- 6 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 181 / 6230144 -- -- -- 181 / 6230144 --
stomach 2 / 26641 2 / 65644 2 / 124767 9 / 448716 2 / 26641 2 / 65644 2 / 124767 9 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 3 / 143630 1 / 100058 -- 263 / 12372003 3 / 143630 1 / 100058 -- 263 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   3 / 32606 1 / 115938   0 / 11737 3 / 32606 1 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 3 / 207932 16 / 479819     3 / 207932 16 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 18 / 38063 6 / 133582 246 / 10193077 -- 18 / 38063 6 / 133582 246 / 10193077 --
vascular 4 / 46250 -- 871 / 13135050 -- 4 / 46250 -- 871 / 13135050 --
white blood cells -- -- 4 / 846268 -- -- -- 4 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --