Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.356572Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 2949 / 3316537 4589 / 2498449 260779 / 114162531 171872 / 109592465 2949 / 3316537 4589 / 2498449 260779 / 114162531 171872 / 109592465
adrenal cortex -- 18 / 9928 -- -- -- 18 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 12 / 16077 120 / 57865 -- 106 / 83577 12 / 16077 120 / 57865 -- 106 / 83577
bone marrow 8 / 14774 16 / 29891 7188 / 5047110 9239 / 4978364 8 / 14774 16 / 29891 7188 / 5047110 9239 / 4978364
brain 79 / 506301 361 / 200215 810 / 729526 5993 / 4997811 79 / 506301 361 / 200215 810 / 729526 5993 / 4997811
cartilage 20 / 15965 49 / 37226 -- 492 / 778035 20 / 15965 49 / 37226 -- 492 / 778035
cerebellum 16 / 90353   62 / 90885 3934 / 1495938 16 / 90353 0 / 0 62 / 90885 3934 / 1495938
cerebrum 20 / 198932 1 / 3422 -- -- 20 / 198932 1 / 3422 -- --
cervix 1 / 3888 62 / 44577 -- -- 1 / 3888 62 / 44577 -- --
colon 7 / 26551 226 / 151167 36 / 98089 567 / 643586 7 / 26551 226 / 151167 36 / 98089 567 / 643586
ear 17 / 16130 -- -- -- 17 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 556 / 246043   -- -- 556 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 8 / 19564 2 / 2857 -- -- 8 / 19564 2 / 2857 -- --
esophagus   4 / 17290 -- -- 0 / 270 4 / 17290 -- --
eye 138 / 128826 287 / 46440 123 / 85898 20823 / 12434232 138 / 128826 287 / 46440 123 / 85898 20823 / 12434232
gastrointestinal tract 20 / 28803 14 / 12721 41 / 45908 -- 20 / 28803 14 / 12721 41 / 45908 --
heart 48 / 76442   105 / 83063 -- 48 / 76442 0 / 1 105 / 83063 --
kidney 8 / 106627 99 / 89898 153 / 155372 27 / 100281 8 / 106627 99 / 89898 153 / 155372 27 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 40 / 96846 184 / 107249 51 / 66308 283 / 214987 40 / 96846 184 / 107249 51 / 66308 283 / 214987
lung 50 / 128150 383 / 170663 485 / 159917 163 / 159059 50 / 128150 383 / 170663 485 / 159917 163 / 159059
lymph node 1 / 62650 56 / 27007 15136 / 5278419 37921 / 4863489 1 / 62650 56 / 27007 15136 / 5278419 37921 / 4863489
lymphoreticular 344 / 17836 274 / 44303 -- -- 344 / 17836 274 / 44303 -- --
mammary gland 7 / 46553 126 / 104307 88062 / 43166038 39609 / 30312656 7 / 46553 126 / 104307 88062 / 43166038 39609 / 30312656
muscle 31 / 74039 205 / 27691 75 / 107836 94 / 61270 31 / 74039 205 / 27691 75 / 107836 94 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 45 / 11462 228 / 89988 79 / 94887 133 / 179472 45 / 11462 228 / 89988 79 / 94887 133 / 179472
pancreas 63 / 7237 99 / 74930 187 / 85728 223 / 189999 63 / 7237 99 / 74930 187 / 85728 223 / 189999
pancreatic islet 336 / 96524 41 / 30072 -- -- 336 / 96524 41 / 30072 -- --
parathyroid   5 / 20557 -- -- 0 / 24 5 / 20557 -- --
peripheral nervous system 10 / 14891   -- -- 10 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 5 / 13260 2 / 1358 -- -- 5 / 13260 2 / 1358 -- --
placenta 55 / 241088 236 / 39531 373 / 207348 -- 55 / 241088 236 / 39531 373 / 207348 --
pooled tissue 156 / 276455   -- -- 156 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 60 / 79993 196 / 107080 643 / 266949 1214 / 491794 60 / 79993 196 / 107080 643 / 266949 1214 / 491794
retina 37 / 29438 -- 419 / 820326 212 / 88490 37 / 29438 -- 419 / 820326 212 / 88490
salivary gland   25 / 10368 -- -- 0 / 2490 25 / 10368 -- --
skin 22 / 73633 328 / 125377 62379 / 26905847 30706 / 34522313 22 / 73633 328 / 125377 62379 / 26905847 30706 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 32 / 52939   -- -- 32 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 15179 / 6230144 -- -- -- 15179 / 6230144 --
stomach 41 / 26641 113 / 65644 187 / 124767 493 / 448716 41 / 26641 113 / 65644 187 / 124767 493 / 448716
synovium 1 / 249 2 / 1650 -- -- 1 / 249 2 / 1650 -- --
testis 31 / 143630 58 / 100058 -- 19079 / 12372003 31 / 143630 58 / 100058 -- 19079 / 12372003
thymus 5 / 4478   -- -- 5 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 10 / 11737 21 / 32606 273 / 115938 407 / 124664 10 / 11737 21 / 32606 273 / 115938 407 / 124664
uncharacterized tissue 533 / 207932 343 / 479819 25 / 21833 154 / 51729 533 / 207932 343 / 479819 25 / 21833 154 / 51729
uterus 11 / 38063 404 / 133582 48101 / 10193077 -- 11 / 38063 404 / 133582 48101 / 10193077 --
vascular 41 / 46250 -- 19275 / 13135050 -- 41 / 46250 -- 19275 / 13135050 --
white blood cells -- -- 1332 / 846268 -- -- -- 1332 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --