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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.356331Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 1628 / 3316537 2612 / 2498449 165989 / 114162531 208038 / 109592465 1628 / 3316537 2612 / 2498449 165989 / 114162531 208038 / 109592465
adrenal cortex -- 21 / 9928 -- -- -- 21 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 3 / 16077 42 / 57865 -- 4 / 83577 3 / 16077 42 / 57865 -- 4 / 83577
bone marrow 13 / 14774 22 / 29891 1170 / 5047110 1205 / 4978364 13 / 14774 22 / 29891 1170 / 5047110 1205 / 4978364
brain 186 / 506301 196 / 200215 594 / 729526 7750 / 4997811 186 / 506301 196 / 200215 594 / 729526 7750 / 4997811
cartilage 3 / 15965 13 / 37226 -- 919 / 778035 3 / 15965 13 / 37226 -- 919 / 778035
cerebellum 36 / 90353   60 / 90885 2600 / 1495938 36 / 90353 0 / 0 60 / 90885 2600 / 1495938
cerebrum 87 / 198932   -- -- 87 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 1 / 3888 42 / 44577 -- -- 1 / 3888 42 / 44577 -- --
colon 8 / 26551 151 / 151167 43 / 98089 1401 / 643586 8 / 26551 151 / 151167 43 / 98089 1401 / 643586
ear 16 / 16130 -- -- -- 16 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 162 / 246043   -- -- 162 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 12 / 19564 3 / 2857 -- -- 12 / 19564 3 / 2857 -- --
esophagus   5 / 17290 -- -- 0 / 270 5 / 17290 -- --
eye 81 / 128826 42 / 46440 79 / 85898 18523 / 12434232 81 / 128826 42 / 46440 79 / 85898 18523 / 12434232
gastrointestinal tract 14 / 28803 12 / 12721 20 / 45908 -- 14 / 28803 12 / 12721 20 / 45908 --
heart 27 / 76442   63 / 83063 -- 27 / 76442 0 / 1 63 / 83063 --
kidney 26 / 106627 73 / 89898 206 / 155372 271 / 100281 26 / 106627 73 / 89898 206 / 155372 271 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 96 / 96846 112 / 107249 52 / 66308 515 / 214987 96 / 96846 112 / 107249 52 / 66308 515 / 214987
lung 54 / 128150 285 / 170663 322 / 159917 267 / 159059 54 / 128150 285 / 170663 322 / 159917 267 / 159059
lymph node 9 / 62650 53 / 27007 12309 / 5278419 16106 / 4863489 9 / 62650 53 / 27007 12309 / 5278419 16106 / 4863489
lymphoreticular 35 / 17836 79 / 44303 -- -- 35 / 17836 79 / 44303 -- --
mammary gland 52 / 46553 77 / 104307 75175 / 43166038 46762 / 30312656 52 / 46553 77 / 104307 75175 / 43166038 46762 / 30312656
muscle 17 / 74039 36 / 27691 13 / 107836 102 / 61270 17 / 74039 36 / 27691 13 / 107836 102 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 4 / 11462 75 / 89988 307 / 94887 289 / 179472 4 / 11462 75 / 89988 307 / 94887 289 / 179472
pancreas 14 / 7237 91 / 74930 118 / 85728 323 / 189999 14 / 7237 91 / 74930 118 / 85728 323 / 189999
pancreatic islet 77 / 96524 35 / 30072 -- -- 77 / 96524 35 / 30072 -- --
parathyroid   3 / 20557 -- -- 0 / 24 3 / 20557 -- --
peripheral nervous system 5 / 14891 1 / 645 -- -- 5 / 14891 1 / 645 -- --
pineal gland 3 / 6170 -- -- -- 3 / 6170 -- -- --
pituitary gland 8 / 13260 1 / 1358 -- -- 8 / 13260 1 / 1358 -- --
placenta 70 / 241088 51 / 39531 200 / 207348 -- 70 / 241088 51 / 39531 200 / 207348 --
pooled tissue 132 / 276455   -- -- 132 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 28 / 79993 153 / 107080 611 / 266949 1050 / 491794 28 / 79993 153 / 107080 611 / 266949 1050 / 491794
retina 6 / 29438 -- 810 / 820326 200 / 88490 6 / 29438 -- 810 / 820326 200 / 88490
salivary gland   24 / 10368 -- -- 0 / 2490 24 / 10368 -- --
skin 23 / 73633 242 / 125377 30445 / 26905847 66484 / 34522313 23 / 73633 242 / 125377 30445 / 26905847 66484 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 25 / 52939   -- -- 25 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 8405 / 6230144 -- -- -- 8405 / 6230144 --
stomach 29 / 26641 64 / 65644 152 / 124767 799 / 448716 29 / 26641 64 / 65644 152 / 124767 799 / 448716
synovium   1 / 1650 -- -- 0 / 249 1 / 1650 -- --
testis 33 / 143630 113 / 100058 -- 42012 / 12372003 33 / 143630 113 / 100058 -- 42012 / 12372003
thymus 3 / 4478 1 / 165 -- -- 3 / 4478 1 / 165 -- --
thyroid 5 / 11737 15 / 32606 204 / 115938 250 / 124664 5 / 11737 15 / 32606 204 / 115938 250 / 124664
uncharacterized tissue 191 / 207932 325 / 479819 55 / 21833 206 / 51729 191 / 207932 325 / 479819 55 / 21833 206 / 51729
uterus 6 / 38063 153 / 133582 10050 / 10193077 -- 6 / 38063 153 / 133582 10050 / 10193077 --
vascular 22 / 46250 -- 23706 / 13135050 -- 22 / 46250 -- 23706 / 13135050 --
white blood cells -- -- 820 / 846268 -- -- -- 820 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --