Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.348365Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 18 / 3316537 9 / 2498449 1396 / 114162531 990 / 109592465 18 / 3316537 9 / 2498449 1396 / 114162531 990 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 1 / 14774   31 / 5047110 29 / 4978364 1 / 14774 0 / 29891 31 / 5047110 29 / 4978364
brain     5 / 729526 67 / 4997811 0 / 506301 0 / 200215 5 / 729526 67 / 4997811
cartilage   1 / 37226 -- 13 / 778035 0 / 15965 1 / 37226 -- 13 / 778035
cerebellum 1 / 90353       1 / 90353 0 / 0 0 / 90885 0 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   2 / 44577 -- -- 0 / 3888 2 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 2 / 151167     1 / 26551 2 / 151167 0 / 98089 0 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue     -- -- 0 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye       8 / 12434232 0 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 8 / 12434232
gastrointestinal tract 2 / 28803   1 / 45908 -- 2 / 28803 0 / 12721 1 / 45908 --
heart     1 / 83063 -- 0 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney   1 / 89898     0 / 106627 1 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 5 / 96846     3 / 214987 5 / 96846 0 / 107249 0 / 66308 3 / 214987
lung 1 / 128150 1 / 170663 6 / 159917 4 / 159059 1 / 128150 1 / 170663 6 / 159917 4 / 159059
lymph node     155 / 5278419 105 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 155 / 5278419 105 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   1 / 104307 39 / 43166038 380 / 30312656 0 / 46553 1 / 104307 39 / 43166038 380 / 30312656
muscle     1 / 107836   0 / 74039 0 / 27691 1 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462   1 / 94887 2 / 179472 1 / 11462 0 / 89988 1 / 94887 2 / 179472
pancreas         0 / 7237 0 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta     6 / 207348 -- 0 / 241088 0 / 39531 6 / 207348 --
pooled tissue 4 / 276455   -- -- 4 / 276455 0 / 0 -- --
prostate     1 / 266949 1 / 491794 0 / 79993 0 / 107080 1 / 266949 1 / 491794
retina   -- 2 / 820326   0 / 29438 -- 2 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 1 / 73633   294 / 26905847 363 / 34522313 1 / 73633 0 / 125377 294 / 26905847 363 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 2 / 6230144 -- -- -- 2 / 6230144 --
stomach     2 / 124767 12 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 2 / 124767 12 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis     --   0 / 143630 0 / 100058 -- 0 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     3 / 115938   0 / 11737 0 / 32606 3 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue   1 / 479819   3 / 51729 0 / 207932 1 / 479819 0 / 21833 3 / 51729
uterus     128 / 10193077 -- 0 / 38063 0 / 133582 128 / 10193077 --
vascular   -- 657 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 657 / 13135050 --
white blood cells -- -- 61 / 846268 -- -- -- 61 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --