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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.3352Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 363 / 3316537 316 / 2498449 3145 / 114162531 5955 / 109592465 363 / 3316537 316 / 2498449 3145 / 114162531 5955 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077 11 / 57865 --   2 / 16077 11 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   16 / 29891 20 / 5047110 70 / 4978364 0 / 14774 16 / 29891 20 / 5047110 70 / 4978364
brain 79 / 506301 66 / 200215 32 / 729526 247 / 4997811 79 / 506301 66 / 200215 32 / 729526 247 / 4997811
cartilage 2 / 15965 3 / 37226 -- 21 / 778035 2 / 15965 3 / 37226 -- 21 / 778035
cerebellum 15 / 90353   1 / 90885 118 / 1495938 15 / 90353 0 / 0 1 / 90885 118 / 1495938
cerebrum 13 / 198932 2 / 3422 -- -- 13 / 198932 2 / 3422 -- --
cervix 2 / 3888 6 / 44577 -- -- 2 / 3888 6 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 10 / 151167 5 / 98089 10 / 643586 1 / 26551 10 / 151167 5 / 98089 10 / 643586
ear 8 / 16130 -- -- -- 8 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 34 / 246043   -- -- 34 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 6 / 19564   -- -- 6 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   7 / 17290 -- -- 0 / 270 7 / 17290 -- --
eye 6 / 128826 7 / 46440 5 / 85898 1972 / 12434232 6 / 128826 7 / 46440 5 / 85898 1972 / 12434232
gastrointestinal tract 6 / 28803   1 / 45908 -- 6 / 28803 0 / 12721 1 / 45908 --
heart 8 / 76442   2 / 83063 -- 8 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney 14 / 106627 11 / 89898 13 / 155372   14 / 106627 11 / 89898 13 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 7 / 96846 19 / 107249 1 / 66308 4 / 214987 7 / 96846 19 / 107249 1 / 66308 4 / 214987
lung 13 / 128150 5 / 170663 2 / 159917 4 / 159059 13 / 128150 5 / 170663 2 / 159917 4 / 159059
lymph node 2 / 62650   163 / 5278419 58 / 4863489 2 / 62650 0 / 27007 163 / 5278419 58 / 4863489
lymphoreticular   2 / 44303 -- -- 0 / 17836 2 / 44303 -- --
mammary gland 6 / 46553 5 / 104307 500 / 43166038 1001 / 30312656 6 / 46553 5 / 104307 500 / 43166038 1001 / 30312656
muscle 4 / 74039 2 / 27691 1 / 107836 3 / 61270 4 / 74039 2 / 27691 1 / 107836 3 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   8 / 89988 3 / 94887 6 / 179472 0 / 11462 8 / 89988 3 / 94887 6 / 179472
pancreas     1 / 85728 3 / 189999 0 / 7237 0 / 74930 1 / 85728 3 / 189999
pancreatic islet 6 / 96524   -- -- 6 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 19 / 241088 2 / 39531 2 / 207348 -- 19 / 241088 2 / 39531 2 / 207348 --
pooled tissue 13 / 276455   -- -- 13 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 5 / 79993 7 / 107080 7 / 266949 17 / 491794 5 / 79993 7 / 107080 7 / 266949 17 / 491794
retina 2 / 29438 -- 12 / 820326 5 / 88490 2 / 29438 -- 12 / 820326 5 / 88490
salivary gland   1 / 10368 -- -- 0 / 2490 1 / 10368 -- --
skin 7 / 73633 10 / 125377 586 / 26905847 582 / 34522313 7 / 73633 10 / 125377 586 / 26905847 582 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 5 / 52939   -- -- 5 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 780 / 6230144 -- -- -- 780 / 6230144 --
stomach 2 / 26641 3 / 65644 6 / 124767 26 / 448716 2 / 26641 3 / 65644 6 / 124767 26 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 30 / 143630 24 / 100058 -- 1797 / 12372003 30 / 143630 24 / 100058 -- 1797 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   1 / 32606 5 / 115938 5 / 124664 0 / 11737 1 / 32606 5 / 115938 5 / 124664
uncharacterized tissue 19 / 207932 74 / 479819   6 / 51729 19 / 207932 74 / 479819 0 / 21833 6 / 51729
uterus 9 / 38063 14 / 133582 474 / 10193077 -- 9 / 38063 14 / 133582 474 / 10193077 --
vascular 16 / 46250 -- 507 / 13135050 -- 16 / 46250 -- 507 / 13135050 --
white blood cells -- -- 16 / 846268 -- -- -- 16 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --