Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.332708Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 521 / 3316537 82 / 2498449 3761 / 114162531 1838 / 109592465 521 / 3316537 82 / 2498449 3761 / 114162531 1838 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 4 / 16077 4 / 57865 --   4 / 16077 4 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     1 / 5047110   0 / 14774 0 / 29891 1 / 5047110 0 / 4978364
brain 32 / 506301 13 / 200215 17 / 729526 121 / 4997811 32 / 506301 13 / 200215 17 / 729526 121 / 4997811
cartilage 17 / 15965 4 / 37226 -- 77 / 778035 17 / 15965 4 / 37226 -- 77 / 778035
cerebellum       14 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 14 / 1495938
cerebrum 12 / 198932   -- -- 12 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 2 / 3888 4 / 44577 -- -- 2 / 3888 4 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 3 / 151167   1 / 643586 1 / 26551 3 / 151167 0 / 98089 1 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 5 / 246043   -- -- 5 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 10 / 19564   -- -- 10 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 10 / 128826   6 / 85898 508 / 12434232 10 / 128826 0 / 46440 6 / 85898 508 / 12434232
gastrointestinal tract 19 / 28803   2 / 45908 -- 19 / 28803 0 / 12721 2 / 45908 --
heart 18 / 76442   3 / 83063 -- 18 / 76442 0 / 1 3 / 83063 --
kidney 26 / 106627 1 / 89898 2 / 155372 3 / 100281 26 / 106627 1 / 89898 2 / 155372 3 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 3 / 96846 2 / 107249 1 / 66308 1 / 214987 3 / 96846 2 / 107249 1 / 66308 1 / 214987
lung 37 / 128150 9 / 170663 5 / 159917   37 / 128150 9 / 170663 5 / 159917 0 / 159059
lymph node   1 / 27007 27 / 5278419 5 / 4863489 0 / 62650 1 / 27007 27 / 5278419 5 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 4 / 46553   2434 / 43166038 547 / 30312656 4 / 46553 0 / 104307 2434 / 43166038 547 / 30312656
muscle 6 / 74039   1 / 107836 4 / 61270 6 / 74039 0 / 27691 1 / 107836 4 / 61270
nervous 4 / 10333   -- -- 4 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462       1 / 11462 0 / 89988 0 / 94887 0 / 179472
pancreas   2 / 74930   1 / 189999 0 / 7237 2 / 74930 0 / 85728 1 / 189999
pancreatic islet 5 / 96524 1 / 30072 -- -- 5 / 96524 1 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 6 / 14891   -- -- 6 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 56 / 241088   1 / 207348 -- 56 / 241088 0 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 29 / 276455   -- -- 29 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 19 / 79993   11 / 266949 2 / 491794 19 / 79993 0 / 107080 11 / 266949 2 / 491794
retina   --     0 / 29438 -- 0 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 41 / 73633   679 / 26905847 529 / 34522313 41 / 73633 0 / 125377 679 / 26905847 529 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 68 / 52939   -- -- 68 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 3 / 6230144 -- -- -- 3 / 6230144 --
stomach 5 / 26641 1 / 65644 4 / 124767 6 / 448716 5 / 26641 1 / 65644 4 / 124767 6 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 34 / 143630 7 / 100058 -- 17 / 12372003 34 / 143630 7 / 100058 -- 17 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737   6 / 115938 2 / 124664 1 / 11737 0 / 32606 6 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue 17 / 207932 22 / 479819     17 / 207932 22 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 9 / 38063 7 / 133582 486 / 10193077 -- 9 / 38063 7 / 133582 486 / 10193077 --
vascular 13 / 46250 -- 67 / 13135050 -- 13 / 46250 -- 67 / 13135050 --
white blood cells -- -- 5 / 846268 -- -- -- 5 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --