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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.300684Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 64 / 3316537 84 / 2498449 1129 / 114162531 2031 / 109592465 64 / 3316537 84 / 2498449 1129 / 114162531 2031 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   2 / 57865 --   0 / 16077 2 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     109 / 5047110 236 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 109 / 5047110 236 / 4978364
brain 8 / 506301 6 / 200215 6 / 729526 35 / 4997811 8 / 506301 6 / 200215 6 / 729526 35 / 4997811
cartilage     -- 6 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 6 / 778035
cerebellum 1 / 90353   2 / 90885 22 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 2 / 90885 22 / 1495938
cerebrum 3 / 198932   -- -- 3 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 1 / 3888 2 / 44577 -- -- 1 / 3888 2 / 44577 -- --
colon   5 / 151167 3 / 98089 10 / 643586 0 / 26551 5 / 151167 3 / 98089 10 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 4 / 246043   -- -- 4 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564 1 / 2857 -- -- 1 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus   4 / 17290 -- -- 0 / 270 4 / 17290 -- --
eye   3 / 46440   21 / 12434232 0 / 128826 3 / 46440 0 / 85898 21 / 12434232
gastrointestinal tract   1 / 12721 2 / 45908 -- 0 / 28803 1 / 12721 2 / 45908 --
heart 2 / 76442     -- 2 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 3 / 106627 3 / 89898 2 / 155372   3 / 106627 3 / 89898 2 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 5 / 96846 3 / 107249   5 / 214987 5 / 96846 3 / 107249 0 / 66308 5 / 214987
lung   4 / 170663   1 / 159059 0 / 128150 4 / 170663 0 / 159917 1 / 159059
lymph node     69 / 5278419 42 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 69 / 5278419 42 / 4863489
lymphoreticular   1 / 44303 -- -- 0 / 17836 1 / 44303 -- --
mammary gland   3 / 104307 136 / 43166038 296 / 30312656 0 / 46553 3 / 104307 136 / 43166038 296 / 30312656
muscle 2 / 74039 1 / 27691     2 / 74039 1 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   5 / 89988 4 / 94887   0 / 11462 5 / 89988 4 / 94887 0 / 179472
pancreas     4 / 85728 2 / 189999 0 / 7237 0 / 74930 4 / 85728 2 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 3 / 241088   3 / 207348 -- 3 / 241088 0 / 39531 3 / 207348 --
pooled tissue 6 / 276455   -- -- 6 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 1 / 79993 7 / 107080 2 / 266949 9 / 491794 1 / 79993 7 / 107080 2 / 266949 9 / 491794
retina 1 / 29438 -- 5 / 820326   1 / 29438 -- 5 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 4 / 73633 4 / 125377 328 / 26905847 811 / 34522313 4 / 73633 4 / 125377 328 / 26905847 811 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 4 / 52939   -- -- 4 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 29 / 6230144 -- -- -- 29 / 6230144 --
stomach   2 / 65644   3 / 448716 0 / 26641 2 / 65644 0 / 124767 3 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 2 / 143630 2 / 100058 -- 531 / 12372003 2 / 143630 2 / 100058 -- 531 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 2 / 11737 9 / 32606 1 / 115938   2 / 11737 9 / 32606 1 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 6 / 207932 13 / 479819   1 / 51729 6 / 207932 13 / 479819 0 / 21833 1 / 51729
uterus 4 / 38063 2 / 133582 305 / 10193077 -- 4 / 38063 2 / 133582 305 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 108 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 108 / 13135050 --
white blood cells -- -- 11 / 846268 -- -- -- 11 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --