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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.299878Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 180 / 3316537 108 / 2498449 230 / 114162531 181 / 109592465 180 / 3316537 108 / 2498449 230 / 114162531 181 / 109592465
adrenal cortex -- 3 / 9928 -- -- -- 3 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   2 / 57865 --   0 / 16077 2 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 1 / 14774     3 / 4978364 1 / 14774 0 / 29891 0 / 5047110 3 / 4978364
brain 23 / 506301 8 / 200215 3 / 729526 5 / 4997811 23 / 506301 8 / 200215 3 / 729526 5 / 4997811
cartilage 1 / 15965 1 / 37226 -- 3 / 778035 1 / 15965 1 / 37226 -- 3 / 778035
cerebellum 3 / 90353     4 / 1495938 3 / 90353 0 / 0 0 / 90885 4 / 1495938
cerebrum 15 / 198932   -- -- 15 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   2 / 44577 -- -- 0 / 3888 2 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 2 / 151167     2 / 26551 2 / 151167 0 / 98089 0 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 13 / 246043   -- -- 13 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 2 / 19564   -- -- 2 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   3 / 17290 -- -- 0 / 270 3 / 17290 -- --
eye 7 / 128826 3 / 46440   39 / 12434232 7 / 128826 3 / 46440 0 / 85898 39 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803 1 / 12721   -- 1 / 28803 1 / 12721 0 / 45908 --
heart 2 / 76442     -- 2 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 5 / 106627 4 / 89898   1 / 100281 5 / 106627 4 / 89898 0 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 2 / 96846 4 / 107249     2 / 96846 4 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung 2 / 128150 14 / 170663 1 / 159917   2 / 128150 14 / 170663 1 / 159917 0 / 159059
lymph node 1 / 62650   2 / 5278419   1 / 62650 0 / 27007 2 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular   1 / 44303 -- -- 0 / 17836 1 / 44303 -- --
mammary gland 1 / 46553 6 / 104307 82 / 43166038 52 / 30312656 1 / 46553 6 / 104307 82 / 43166038 52 / 30312656
muscle 2 / 74039       2 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous 2 / 10333   -- -- 2 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   1 / 89988     0 / 11462 1 / 89988 0 / 94887 0 / 179472
pancreas 2 / 7237 2 / 74930     2 / 7237 2 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet 10 / 96524   -- -- 10 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 32 / 241088 1 / 39531   -- 32 / 241088 1 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 4 / 276455   -- -- 4 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 2 / 79993 18 / 107080   1 / 491794 2 / 79993 18 / 107080 0 / 266949 1 / 491794
retina 1 / 29438 -- 1 / 820326   1 / 29438 -- 1 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 6 / 73633 4 / 125377 111 / 26905847 57 / 34522313 6 / 73633 4 / 125377 111 / 26905847 57 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 8 / 6230144 -- -- -- 8 / 6230144 --
stomach   2 / 65644     0 / 26641 2 / 65644 0 / 124767 0 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 4 / 143630 7 / 100058 -- 16 / 12372003 4 / 143630 7 / 100058 -- 16 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   1 / 32606     0 / 11737 1 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 18 / 207932 17 / 479819     18 / 207932 17 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 3 / 38063 1 / 133582 4 / 10193077 -- 3 / 38063 1 / 133582 4 / 10193077 --
vascular 9 / 46250 -- 16 / 13135050 -- 9 / 46250 -- 16 / 13135050 --
white blood cells -- -- 2 / 846268 -- -- -- 2 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --