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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.299002Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 283 / 3316537 773 / 2498449 22749 / 114162531 10901 / 109592465 283 / 3316537 773 / 2498449 22749 / 114162531 10901 / 109592465
adrenal cortex -- 5 / 9928 -- -- -- 5 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077 11 / 57865 -- 19 / 83577 2 / 16077 11 / 57865 -- 19 / 83577
bone marrow     328 / 5047110 346 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 328 / 5047110 346 / 4978364
brain 8 / 506301 47 / 200215 85 / 729526 454 / 4997811 8 / 506301 47 / 200215 85 / 729526 454 / 4997811
cartilage 1 / 15965 7 / 37226 -- 70 / 778035 1 / 15965 7 / 37226 -- 70 / 778035
cerebellum 3 / 90353   2 / 90885 287 / 1495938 3 / 90353 0 / 0 2 / 90885 287 / 1495938
cerebrum 7 / 198932   -- -- 7 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   16 / 44577 -- -- 0 / 3888 16 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 33 / 151167 5 / 98089 160 / 643586 1 / 26551 33 / 151167 5 / 98089 160 / 643586
ear 2 / 16130 -- -- -- 2 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 51 / 246043   -- -- 51 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 3 / 19564   -- -- 3 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 15 / 128826 35 / 46440 15 / 85898 1822 / 12434232 15 / 128826 35 / 46440 15 / 85898 1822 / 12434232
gastrointestinal tract   4 / 12721 3 / 45908 -- 0 / 28803 4 / 12721 3 / 45908 --
heart 12 / 76442   6 / 83063 -- 12 / 76442 0 / 1 6 / 83063 --
kidney 4 / 106627 6 / 89898 14 / 155372 47 / 100281 4 / 106627 6 / 89898 14 / 155372 47 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 4 / 96846 32 / 107249 3 / 66308 23 / 214987 4 / 96846 32 / 107249 3 / 66308 23 / 214987
lung 11 / 128150 40 / 170663 18 / 159917 15 / 159059 11 / 128150 40 / 170663 18 / 159917 15 / 159059
lymph node 2 / 62650 1 / 27007 313 / 5278419 136 / 4863489 2 / 62650 1 / 27007 313 / 5278419 136 / 4863489
lymphoreticular 3 / 17836 29 / 44303 -- -- 3 / 17836 29 / 44303 -- --
mammary gland   11 / 104307 17436 / 43166038 3647 / 30312656 0 / 46553 11 / 104307 17436 / 43166038 3647 / 30312656
muscle 6 / 74039 21 / 27691 1 / 107836 4 / 61270 6 / 74039 21 / 27691 1 / 107836 4 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 5 / 11462 74 / 89988 86 / 94887 49 / 179472 5 / 11462 74 / 89988 86 / 94887 49 / 179472
pancreas   187 / 74930 20 / 85728 59 / 189999 0 / 7237 187 / 74930 20 / 85728 59 / 189999
pancreatic islet 10 / 96524 16 / 30072 -- -- 10 / 96524 16 / 30072 -- --
parathyroid   4 / 20557 -- -- 0 / 24 4 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 11 / 241088 16 / 39531 9 / 207348 -- 11 / 241088 16 / 39531 9 / 207348 --
pooled tissue 18 / 276455   -- -- 18 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 3 / 79993 14 / 107080 27 / 266949 65 / 491794 3 / 79993 14 / 107080 27 / 266949 65 / 491794
retina 5 / 29438 -- 40 / 820326 13 / 88490 5 / 29438 -- 40 / 820326 13 / 88490
salivary gland   3 / 10368 -- -- 0 / 2490 3 / 10368 -- --
skin 18 / 73633 30 / 125377 1483 / 26905847 1815 / 34522313 18 / 73633 30 / 125377 1483 / 26905847 1815 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 911 / 6230144 -- -- -- 911 / 6230144 --
stomach 2 / 26641 11 / 65644 12 / 124767 63 / 448716 2 / 26641 11 / 65644 12 / 124767 63 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 10 / 143630 1 / 100058 -- 1789 / 12372003 10 / 143630 1 / 100058 -- 1789 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737 5 / 32606 10 / 115938 4 / 124664 1 / 11737 5 / 32606 10 / 115938 4 / 124664
uncharacterized tissue 53 / 207932 69 / 479819 2 / 21833 14 / 51729 53 / 207932 69 / 479819 2 / 21833 14 / 51729
uterus 9 / 38063 45 / 133582 1384 / 10193077 -- 9 / 38063 45 / 133582 1384 / 10193077 --
vascular 2 / 46250 -- 480 / 13135050 -- 2 / 46250 -- 480 / 13135050 --
white blood cells -- -- 56 / 846268 -- -- -- 56 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --