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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.29344Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 32 / 3316537 61 / 2498449 1395 / 114162531 1479 / 109592465 32 / 3316537 61 / 2498449 1395 / 114162531 1479 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   4 / 57865 -- 3 / 83577 0 / 16077 4 / 57865 -- 3 / 83577
bone marrow     4 / 5047110 12 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 4 / 5047110 12 / 4978364
brain 2 / 506301 6 / 200215 7 / 729526 19 / 4997811 2 / 506301 6 / 200215 7 / 729526 19 / 4997811
cartilage   2 / 37226 -- 6 / 778035 0 / 15965 2 / 37226 -- 6 / 778035
cerebellum       2 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 2 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   2 / 44577 -- -- 0 / 3888 2 / 44577 -- --
colon   5 / 151167 3 / 98089 14 / 643586 0 / 26551 5 / 151167 3 / 98089 14 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 2 / 246043   -- -- 2 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 6 / 128826     75 / 12434232 6 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 75 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 1 / 76442   3 / 83063 -- 1 / 76442 0 / 1 3 / 83063 --
kidney   4 / 89898     0 / 106627 4 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver     1 / 66308 1 / 214987 0 / 96846 0 / 107249 1 / 66308 1 / 214987
lung 3 / 128150 3 / 170663 4 / 159917 1 / 159059 3 / 128150 3 / 170663 4 / 159917 1 / 159059
lymph node 4 / 62650   39 / 5278419   4 / 62650 0 / 27007 39 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular   4 / 44303 -- -- 0 / 17836 4 / 44303 -- --
mammary gland 2 / 46553   758 / 43166038 1112 / 30312656 2 / 46553 0 / 104307 758 / 43166038 1112 / 30312656
muscle         0 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   3 / 89988   2 / 179472 0 / 11462 3 / 89988 0 / 94887 2 / 179472
pancreas   6 / 74930   3 / 189999 0 / 7237 6 / 74930 0 / 85728 3 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 4 / 241088     -- 4 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 3 / 276455   -- -- 3 / 276455 0 / 0 -- --
prostate   4 / 107080 2 / 266949 10 / 491794 0 / 79993 4 / 107080 2 / 266949 10 / 491794
retina   -- 4 / 820326   0 / 29438 -- 4 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin   4 / 125377 215 / 26905847 216 / 34522313 0 / 73633 4 / 125377 215 / 26905847 216 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 4 / 6230144 -- -- -- 4 / 6230144 --
stomach   2 / 65644   1 / 448716 0 / 26641 2 / 65644 0 / 124767 1 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis     --   0 / 143630 0 / 100058 -- 0 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     1 / 115938   0 / 11737 0 / 32606 1 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 3 / 207932 9 / 479819   2 / 51729 3 / 207932 9 / 479819 0 / 21833 2 / 51729
uterus   3 / 133582 44 / 10193077 -- 0 / 38063 3 / 133582 44 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 277 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 277 / 13135050 --
white blood cells -- -- 29 / 846268 -- -- -- 29 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --