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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.292493Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 2265 / 3316537 2211 / 2498449 64863 / 114162531 32800 / 109592465 2265 / 3316537 2211 / 2498449 64863 / 114162531 32800 / 109592465
adrenal cortex -- 2 / 9928 -- -- -- 2 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 9 / 16077 15 / 57865 -- 1 / 83577 9 / 16077 15 / 57865 -- 1 / 83577
bone marrow 8 / 14774 56 / 29891 383 / 5047110 356 / 4978364 8 / 14774 56 / 29891 383 / 5047110 356 / 4978364
brain 356 / 506301 251 / 200215 152 / 729526 1463 / 4997811 356 / 506301 251 / 200215 152 / 729526 1463 / 4997811
cartilage 19 / 15965 11 / 37226 -- 96 / 778035 19 / 15965 11 / 37226 -- 96 / 778035
cerebellum 86 / 90353   13 / 90885 457 / 1495938 86 / 90353 0 / 0 13 / 90885 457 / 1495938
cerebrum 170 / 198932 26 / 3422 -- -- 170 / 198932 26 / 3422 -- --
cervix 7 / 3888 45 / 44577 -- -- 7 / 3888 45 / 44577 -- --
colon 13 / 26551 66 / 151167 12 / 98089 415 / 643586 13 / 26551 66 / 151167 12 / 98089 415 / 643586
ear 8 / 16130 -- -- -- 8 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 128 / 246043   -- -- 128 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 43 / 19564   -- -- 43 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   52 / 17290 -- -- 0 / 270 52 / 17290 -- --
eye 39 / 128826 54 / 46440 16 / 85898 6173 / 12434232 39 / 128826 54 / 46440 16 / 85898 6173 / 12434232
gastrointestinal tract 56 / 28803 14 / 12721   -- 56 / 28803 14 / 12721 0 / 45908 --
heart 49 / 76442   18 / 83063 -- 49 / 76442 0 / 1 18 / 83063 --
kidney 115 / 106627 54 / 89898 69 / 155372 26 / 100281 115 / 106627 54 / 89898 69 / 155372 26 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 17 / 96846 135 / 107249 10 / 66308 55 / 214987 17 / 96846 135 / 107249 10 / 66308 55 / 214987
lung 47 / 128150 81 / 170663 44 / 159917 31 / 159059 47 / 128150 81 / 170663 44 / 159917 31 / 159059
lymph node 3 / 62650 13 / 27007 965 / 5278419 429 / 4863489 3 / 62650 13 / 27007 965 / 5278419 429 / 4863489
lymphoreticular 10 / 17836 25 / 44303 -- -- 10 / 17836 25 / 44303 -- --
mammary gland 11 / 46553 83 / 104307 43511 / 43166038 7607 / 30312656 11 / 46553 83 / 104307 43511 / 43166038 7607 / 30312656
muscle 56 / 74039 24 / 27691 13 / 107836 11 / 61270 56 / 74039 24 / 27691 13 / 107836 11 / 61270
nervous 2 / 10333   -- -- 2 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 3 / 11462 50 / 89988 38 / 94887 54 / 179472 3 / 11462 50 / 89988 38 / 94887 54 / 179472
pancreas   31 / 74930 20 / 85728 41 / 189999 0 / 7237 31 / 74930 20 / 85728 41 / 189999
pancreatic islet 21 / 96524 2 / 30072 -- -- 21 / 96524 2 / 30072 -- --
parathyroid   3 / 20557 -- -- 0 / 24 3 / 20557 -- --
peripheral nervous system 5 / 14891   -- -- 5 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland   2 / 1358 -- -- 0 / 13260 2 / 1358 -- --
placenta 169 / 241088 82 / 39531 63 / 207348 -- 169 / 241088 82 / 39531 63 / 207348 --
pooled tissue 32 / 276455   -- -- 32 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 45 / 79993 49 / 107080 45 / 266949 117 / 491794 45 / 79993 49 / 107080 45 / 266949 117 / 491794
retina 5 / 29438 -- 149 / 820326 51 / 88490 5 / 29438 -- 149 / 820326 51 / 88490
salivary gland   3 / 10368 -- -- 0 / 2490 3 / 10368 -- --
skin 35 / 73633 314 / 125377 8128 / 26905847 11645 / 34522313 35 / 73633 314 / 125377 8128 / 26905847 11645 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 56 / 52939   -- -- 56 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 2990 / 6230144 -- -- -- 2990 / 6230144 --
stomach 11 / 26641 16 / 65644 30 / 124767 111 / 448716 11 / 26641 16 / 65644 30 / 124767 111 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 300 / 143630 121 / 100058 -- 3585 / 12372003 300 / 143630 121 / 100058 -- 3585 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 12 / 11737 16 / 32606 40 / 115938 52 / 124664 12 / 11737 16 / 32606 40 / 115938 52 / 124664
uncharacterized tissue 212 / 207932 420 / 479819 2 / 21833 24 / 51729 212 / 207932 420 / 479819 2 / 21833 24 / 51729
uterus 10 / 38063 95 / 133582 2568 / 10193077 -- 10 / 38063 95 / 133582 2568 / 10193077 --
vascular 93 / 46250 -- 5410 / 13135050 -- 93 / 46250 -- 5410 / 13135050 --
white blood cells -- -- 174 / 846268 -- -- -- 174 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --