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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.290758Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 783 / 3316537 775 / 2498449 6956 / 114162531 7374 / 109592465 783 / 3316537 775 / 2498449 6956 / 114162531 7374 / 109592465
adrenal cortex -- 5 / 9928 -- -- -- 5 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   8 / 57865 -- 18 / 83577 0 / 16077 8 / 57865 -- 18 / 83577
bone marrow 1 / 14774 3 / 29891 56 / 5047110 142 / 4978364 1 / 14774 3 / 29891 56 / 5047110 142 / 4978364
brain 108 / 506301 50 / 200215 96 / 729526 1049 / 4997811 108 / 506301 50 / 200215 96 / 729526 1049 / 4997811
cartilage 2 / 15965 11 / 37226 -- 200 / 778035 2 / 15965 11 / 37226 -- 200 / 778035
cerebellum 20 / 90353   9 / 90885 208 / 1495938 20 / 90353 0 / 0 9 / 90885 208 / 1495938
cerebrum 78 / 198932   -- -- 78 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   10 / 44577 -- -- 0 / 3888 10 / 44577 -- --
colon 3 / 26551 55 / 151167 9 / 98089 70 / 643586 3 / 26551 55 / 151167 9 / 98089 70 / 643586
ear 2 / 16130 -- -- -- 2 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 97 / 246043   -- -- 97 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 3 / 19564   -- -- 3 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   2 / 17290 -- -- 0 / 270 2 / 17290 -- --
eye 37 / 128826 32 / 46440 17 / 85898 389 / 12434232 37 / 128826 32 / 46440 17 / 85898 389 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803 9 / 12721 8 / 45908 -- 1 / 28803 9 / 12721 8 / 45908 --
heart 17 / 76442   6 / 83063 -- 17 / 76442 0 / 1 6 / 83063 --
kidney 9 / 106627 32 / 89898 20 / 155372 19 / 100281 9 / 106627 32 / 89898 20 / 155372 19 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 7 / 96846 19 / 107249 2 / 66308 15 / 214987 7 / 96846 19 / 107249 2 / 66308 15 / 214987
lung 23 / 128150 57 / 170663 23 / 159917 23 / 159059 23 / 128150 57 / 170663 23 / 159917 23 / 159059
lymph node 10 / 62650 3 / 27007 315 / 5278419 70 / 4863489 10 / 62650 3 / 27007 315 / 5278419 70 / 4863489
lymphoreticular 7 / 17836 40 / 44303 -- -- 7 / 17836 40 / 44303 -- --
mammary gland 13 / 46553 30 / 104307 3483 / 43166038 1977 / 30312656 13 / 46553 30 / 104307 3483 / 43166038 1977 / 30312656
muscle 4 / 74039 17 / 27691 3 / 107836 4 / 61270 4 / 74039 17 / 27691 3 / 107836 4 / 61270
nervous 4 / 10333   -- -- 4 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 4 / 11462 27 / 89988 19 / 94887 25 / 179472 4 / 11462 27 / 89988 19 / 94887 25 / 179472
pancreas   13 / 74930 8 / 85728 22 / 189999 0 / 7237 13 / 74930 8 / 85728 22 / 189999
pancreatic islet 5 / 96524 11 / 30072 -- -- 5 / 96524 11 / 30072 -- --
parathyroid   7 / 20557 -- -- 0 / 24 7 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 6 / 6170 -- -- -- 6 / 6170 -- -- --
pituitary gland 6 / 13260 1 / 1358 -- -- 6 / 13260 1 / 1358 -- --
placenta 139 / 241088 51 / 39531 94 / 207348 -- 139 / 241088 51 / 39531 94 / 207348 --
pooled tissue 37 / 276455   -- -- 37 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 11 / 79993 41 / 107080 15 / 266949 56 / 491794 11 / 79993 41 / 107080 15 / 266949 56 / 491794
retina 17 / 29438 -- 284 / 820326 11 / 88490 17 / 29438 -- 284 / 820326 11 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 12 / 73633 35 / 125377 556 / 26905847 1332 / 34522313 12 / 73633 35 / 125377 556 / 26905847 1332 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 4 / 52939   -- -- 4 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 336 / 6230144 -- -- -- 336 / 6230144 --
stomach 3 / 26641 11 / 65644 11 / 124767 79 / 448716 3 / 26641 11 / 65644 11 / 124767 79 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 21 / 143630 52 / 100058 -- 1640 / 12372003 21 / 143630 52 / 100058 -- 1640 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737 14 / 32606 20 / 115938 13 / 124664 1 / 11737 14 / 32606 20 / 115938 13 / 124664
uncharacterized tissue 58 / 207932 94 / 479819 4 / 21833 12 / 51729 58 / 207932 94 / 479819 4 / 21833 12 / 51729
uterus 6 / 38063 35 / 133582 1311 / 10193077 -- 6 / 38063 35 / 133582 1311 / 10193077 --
vascular 3 / 46250 -- 218 / 13135050 -- 3 / 46250 -- 218 / 13135050 --
white blood cells -- -- 33 / 846268 -- -- -- 33 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --