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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.28988Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 181 / 3316537 107 / 2498449 8711 / 114162531 7061 / 109592465 181 / 3316537 107 / 2498449 8711 / 114162531 7061 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   5 / 57865 --   0 / 16077 5 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   2 / 29891 138 / 5047110 62 / 4978364 0 / 14774 2 / 29891 138 / 5047110 62 / 4978364
brain 3 / 506301 18 / 200215 20 / 729526 256 / 4997811 3 / 506301 18 / 200215 20 / 729526 256 / 4997811
cartilage   6 / 37226 -- 148 / 778035 0 / 15965 6 / 37226 -- 148 / 778035
cerebellum 1 / 90353   6 / 90885 34 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 6 / 90885 34 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   2 / 44577 -- -- 0 / 3888 2 / 44577 -- --
colon   6 / 151167 5 / 98089 36 / 643586 0 / 26551 6 / 151167 5 / 98089 36 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 5 / 246043   -- -- 5 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 3 / 19564 1 / 2857 -- -- 3 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 5 / 128826   2 / 85898 154 / 12434232 5 / 128826 0 / 46440 2 / 85898 154 / 12434232
gastrointestinal tract     1 / 45908 -- 0 / 28803 0 / 12721 1 / 45908 --
heart 4 / 76442   13 / 83063 -- 4 / 76442 0 / 1 13 / 83063 --
kidney 14 / 106627 3 / 89898 9 / 155372 1 / 100281 14 / 106627 3 / 89898 9 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 15 / 96846 5 / 107249 13 / 66308 3 / 214987 15 / 96846 5 / 107249 13 / 66308 3 / 214987
lung 5 / 128150 7 / 170663 24 / 159917 11 / 159059 5 / 128150 7 / 170663 24 / 159917 11 / 159059
lymph node 6 / 62650   225 / 5278419 133 / 4863489 6 / 62650 0 / 27007 225 / 5278419 133 / 4863489
lymphoreticular   1 / 44303 -- -- 0 / 17836 1 / 44303 -- --
mammary gland   3 / 104307 3675 / 43166038 3305 / 30312656 0 / 46553 3 / 104307 3675 / 43166038 3305 / 30312656
muscle 4 / 74039 1 / 27691 3 / 107836 1 / 61270 4 / 74039 1 / 27691 3 / 107836 1 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary     2 / 94887 7 / 179472 0 / 11462 0 / 89988 2 / 94887 7 / 179472
pancreas   2 / 74930 41 / 85728 4 / 189999 0 / 7237 2 / 74930 41 / 85728 4 / 189999
pancreatic islet 12 / 96524 3 / 30072 -- -- 12 / 96524 3 / 30072 -- --
parathyroid   2 / 20557 -- -- 0 / 24 2 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 33 / 241088   102 / 207348 -- 33 / 241088 0 / 39531 102 / 207348 --
pooled tissue 24 / 276455   -- -- 24 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 2 / 79993 1 / 107080 5 / 266949 12 / 491794 2 / 79993 1 / 107080 5 / 266949 12 / 491794
retina   -- 22 / 820326 2 / 88490 0 / 29438 -- 22 / 820326 2 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 15 / 73633 8 / 125377 3490 / 26905847 2602 / 34522313 15 / 73633 8 / 125377 3490 / 26905847 2602 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 2 / 52939   -- -- 2 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 209 / 6230144 -- -- -- 209 / 6230144 --
stomach 4 / 26641 3 / 65644 2 / 124767 39 / 448716 4 / 26641 3 / 65644 2 / 124767 39 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis   7 / 100058 -- 242 / 12372003 0 / 143630 7 / 100058 -- 242 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     6 / 115938 5 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 6 / 115938 5 / 124664
uncharacterized tissue 8 / 207932 19 / 479819 2 / 21833 4 / 51729 8 / 207932 19 / 479819 2 / 21833 4 / 51729
uterus 12 / 38063 1 / 133582 73 / 10193077 -- 12 / 38063 1 / 133582 73 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 433 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 433 / 13135050 --
white blood cells -- -- 190 / 846268 -- -- -- 190 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --