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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.289293Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 122 / 3316537 15 / 2498449 1279 / 114162531 1347 / 109592465 122 / 3316537 15 / 2498449 1279 / 114162531 1347 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   1 / 57865 --   0 / 16077 1 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     1 / 5047110 14 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 1 / 5047110 14 / 4978364
brain 13 / 506301   1 / 729526 60 / 4997811 13 / 506301 0 / 200215 1 / 729526 60 / 4997811
cartilage 2 / 15965 1 / 37226 -- 1 / 778035 2 / 15965 1 / 37226 -- 1 / 778035
cerebellum     1 / 90885 14 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 1 / 90885 14 / 1495938
cerebrum 4 / 198932   -- -- 4 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon       1 / 643586 0 / 26551 0 / 151167 0 / 98089 1 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 18 / 246043   -- -- 18 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 6 / 128826     190 / 12434232 6 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 190 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart       -- 0 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 2 / 106627 1 / 89898     2 / 106627 1 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 3 / 96846 2 / 107249   1 / 214987 3 / 96846 2 / 107249 0 / 66308 1 / 214987
lung 3 / 128150 2 / 170663   3 / 159059 3 / 128150 2 / 170663 0 / 159917 3 / 159059
lymph node     66 / 5278419 27 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 66 / 5278419 27 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland     21 / 43166038 247 / 30312656 0 / 46553 0 / 104307 21 / 43166038 247 / 30312656
muscle 3 / 74039     1 / 61270 3 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 1 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary       2 / 179472 0 / 11462 0 / 89988 0 / 94887 2 / 179472
pancreas   1 / 74930 1 / 85728   0 / 7237 1 / 74930 1 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet 7 / 96524   -- -- 7 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 2 / 13260   -- -- 2 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 26 / 241088 1 / 39531   -- 26 / 241088 1 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 20 / 276455   -- -- 20 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 9 / 79993   4 / 266949   9 / 79993 0 / 107080 4 / 266949 0 / 491794
retina   -- 40 / 820326 3 / 88490 0 / 29438 -- 40 / 820326 3 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin     654 / 26905847 722 / 34522313 0 / 73633 0 / 125377 654 / 26905847 722 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 111 / 6230144 -- -- -- 111 / 6230144 --
stomach         0 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 0 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis     -- 61 / 12372003 0 / 143630 0 / 100058 -- 61 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     4 / 115938   0 / 11737 0 / 32606 4 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue   4 / 479819     0 / 207932 4 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 3 / 38063 2 / 133582 220 / 10193077 -- 3 / 38063 2 / 133582 220 / 10193077 --
vascular   -- 150 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 150 / 13135050 --
white blood cells -- -- 5 / 846268 -- -- -- 5 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --