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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.288800Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 76 / 3316537 93 / 2498449 689 / 114162531 1019 / 109592465 76 / 3316537 93 / 2498449 689 / 114162531 1019 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   3 / 57865 -- 3 / 83577 0 / 16077 3 / 57865 -- 3 / 83577
bone marrow     9 / 5047110 8 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 9 / 5047110 8 / 4978364
brain 24 / 506301 11 / 200215 13 / 729526 137 / 4997811 24 / 506301 11 / 200215 13 / 729526 137 / 4997811
cartilage     -- 2 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 2 / 778035
cerebellum 3 / 90353   4 / 90885 33 / 1495938 3 / 90353 0 / 0 4 / 90885 33 / 1495938
cerebrum 2 / 198932   -- -- 2 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon       1 / 643586 0 / 26551 0 / 151167 0 / 98089 1 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 3 / 246043   -- -- 3 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 3 / 128826 3 / 46440 3 / 85898 362 / 12434232 3 / 128826 3 / 46440 3 / 85898 362 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803   1 / 45908 -- 1 / 28803 0 / 12721 1 / 45908 --
heart 3 / 76442   3 / 83063 -- 3 / 76442 0 / 1 3 / 83063 --
kidney 1 / 106627 3 / 89898 5 / 155372   1 / 106627 3 / 89898 5 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 2 / 96846 2 / 107249     2 / 96846 2 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung 3 / 128150 7 / 170663 1 / 159917 3 / 159059 3 / 128150 7 / 170663 1 / 159917 3 / 159059
lymph node 1 / 62650   49 / 5278419 2 / 4863489 1 / 62650 0 / 27007 49 / 5278419 2 / 4863489
lymphoreticular   5 / 44303 -- -- 0 / 17836 5 / 44303 -- --
mammary gland     143 / 43166038 157 / 30312656 0 / 46553 0 / 104307 143 / 43166038 157 / 30312656
muscle 3 / 74039   3 / 107836 1 / 61270 3 / 74039 0 / 27691 3 / 107836 1 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 4 / 89988 2 / 94887 5 / 179472 1 / 11462 4 / 89988 2 / 94887 5 / 179472
pancreas       7 / 189999 0 / 7237 0 / 74930 0 / 85728 7 / 189999
pancreatic islet   2 / 30072 -- -- 0 / 96524 2 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 1 / 241088 8 / 39531 2 / 207348 -- 1 / 241088 8 / 39531 2 / 207348 --
pooled tissue 14 / 276455   -- -- 14 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 3 / 79993   4 / 266949 7 / 491794 3 / 79993 0 / 107080 4 / 266949 7 / 491794
retina   -- 11 / 820326 8 / 88490 0 / 29438 -- 11 / 820326 8 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin   9 / 125377 100 / 26905847 187 / 34522313 0 / 73633 9 / 125377 100 / 26905847 187 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 86 / 6230144 -- -- -- 86 / 6230144 --
stomach     1 / 124767   0 / 26641 0 / 65644 1 / 124767 0 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 3 / 143630 1 / 100058 -- 94 / 12372003 3 / 143630 1 / 100058 -- 94 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid       2 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue 2 / 207932 34 / 479819     2 / 207932 34 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 1 / 38063   171 / 10193077 -- 1 / 38063 0 / 133582 171 / 10193077 --
vascular   -- 70 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 70 / 13135050 --
white blood cells -- -- 8 / 846268 -- -- -- 8 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --