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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.280378Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 210 / 3316537 205 / 2498449 2005 / 114162531 2491 / 109592465 210 / 3316537 205 / 2498449 2005 / 114162531 2491 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   3 / 57865 -- 1 / 83577 0 / 16077 3 / 57865 -- 1 / 83577
bone marrow 1 / 14774 8 / 29891 155 / 5047110 325 / 4978364 1 / 14774 8 / 29891 155 / 5047110 325 / 4978364
brain 36 / 506301 15 / 200215 11 / 729526 122 / 4997811 36 / 506301 15 / 200215 11 / 729526 122 / 4997811
cartilage   2 / 37226 -- 55 / 778035 0 / 15965 2 / 37226 -- 55 / 778035
cerebellum 3 / 90353   1 / 90885 30 / 1495938 3 / 90353 0 / 0 1 / 90885 30 / 1495938
cerebrum 4 / 198932   -- -- 4 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   7 / 44577 -- -- 0 / 3888 7 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 2 / 151167 2 / 98089 19 / 643586 2 / 26551 2 / 151167 2 / 98089 19 / 643586
ear 4 / 16130 -- -- -- 4 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 15 / 246043   -- -- 15 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   3 / 17290 -- -- 0 / 270 3 / 17290 -- --
eye 11 / 128826 5 / 46440 6 / 85898 601 / 12434232 11 / 128826 5 / 46440 6 / 85898 601 / 12434232
gastrointestinal tract     4 / 45908 -- 0 / 28803 0 / 12721 4 / 45908 --
heart 7 / 76442   1 / 83063 -- 7 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 3 / 106627 9 / 89898 6 / 155372 2 / 100281 3 / 106627 9 / 89898 6 / 155372 2 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 10 / 96846 10 / 107249     10 / 96846 10 / 107249 0 / 66308 0 / 214987
lung 21 / 128150 9 / 170663 7 / 159917 6 / 159059 21 / 128150 9 / 170663 7 / 159917 6 / 159059
lymph node 7 / 62650 2 / 27007 37 / 5278419 36 / 4863489 7 / 62650 2 / 27007 37 / 5278419 36 / 4863489
lymphoreticular   3 / 44303 -- -- 0 / 17836 3 / 44303 -- --
mammary gland   19 / 104307 1079 / 43166038 537 / 30312656 0 / 46553 19 / 104307 1079 / 43166038 537 / 30312656
muscle 10 / 74039 2 / 27691 2 / 107836 1 / 61270 10 / 74039 2 / 27691 2 / 107836 1 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 5 / 11462 7 / 89988 4 / 94887 12 / 179472 5 / 11462 7 / 89988 4 / 94887 12 / 179472
pancreas     10 / 85728 12 / 189999 0 / 7237 0 / 74930 10 / 85728 12 / 189999
pancreatic islet 2 / 96524   -- -- 2 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 6 / 241088 1 / 39531 5 / 207348 -- 6 / 241088 1 / 39531 5 / 207348 --
pooled tissue 28 / 276455   -- -- 28 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 3 / 79993 11 / 107080 6 / 266949 31 / 491794 3 / 79993 11 / 107080 6 / 266949 31 / 491794
retina   -- 8 / 820326 1 / 88490 0 / 29438 -- 8 / 820326 1 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 4 / 73633 7 / 125377 246 / 26905847 340 / 34522313 4 / 73633 7 / 125377 246 / 26905847 340 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 206 / 6230144 -- -- -- 206 / 6230144 --
stomach   9 / 65644 11 / 124767 16 / 448716 0 / 26641 9 / 65644 11 / 124767 16 / 448716
synovium 1 / 249   -- -- 1 / 249 0 / 1650 -- --
testis 5 / 143630 20 / 100058 -- 342 / 12372003 5 / 143630 20 / 100058 -- 342 / 12372003
thymus 2 / 4478   -- -- 2 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     2 / 115938   0 / 11737 0 / 32606 2 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 9 / 207932 42 / 479819 1 / 21833 2 / 51729 9 / 207932 42 / 479819 1 / 21833 2 / 51729
uterus 3 / 38063 7 / 133582 46 / 10193077 -- 3 / 38063 7 / 133582 46 / 10193077 --
vascular 5 / 46250 -- 129 / 13135050 -- 5 / 46250 -- 129 / 13135050 --
white blood cells -- -- 20 / 846268 -- -- -- 20 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --