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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.280342Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 1301 / 3316537 580 / 2498449 11760 / 114162531 7725 / 109592465 1301 / 3316537 580 / 2498449 11760 / 114162531 7725 / 109592465
adrenal cortex -- 2 / 9928 -- -- -- 2 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 3 / 16077 5 / 57865 --   3 / 16077 5 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 4 / 14774 2 / 29891 29 / 5047110 14 / 4978364 4 / 14774 2 / 29891 29 / 5047110 14 / 4978364
brain 395 / 506301 23 / 200215 162 / 729526 877 / 4997811 395 / 506301 23 / 200215 162 / 729526 877 / 4997811
cartilage 3 / 15965 7 / 37226 -- 36 / 778035 3 / 15965 7 / 37226 -- 36 / 778035
cerebellum 160 / 90353   24 / 90885 226 / 1495938 160 / 90353 0 / 0 24 / 90885 226 / 1495938
cerebrum 138 / 198932 3 / 3422 -- -- 138 / 198932 3 / 3422 -- --
cervix   2 / 44577 -- -- 0 / 3888 2 / 44577 -- --
colon 5 / 26551 24 / 151167 3 / 98089 27 / 643586 5 / 26551 24 / 151167 3 / 98089 27 / 643586
ear 7 / 16130 -- -- -- 7 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 80 / 246043   -- -- 80 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 2 / 19564 1 / 2857 -- -- 2 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus   9 / 17290 -- -- 0 / 270 9 / 17290 -- --
eye 23 / 128826 11 / 46440 10 / 85898 517 / 12434232 23 / 128826 11 / 46440 10 / 85898 517 / 12434232
gastrointestinal tract 3 / 28803 3 / 12721 3 / 45908 -- 3 / 28803 3 / 12721 3 / 45908 --
heart 25 / 76442   15 / 83063 -- 25 / 76442 0 / 1 15 / 83063 --
kidney 26 / 106627 22 / 89898 16 / 155372   26 / 106627 22 / 89898 16 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 22 / 96846 25 / 107249 10 / 66308 15 / 214987 22 / 96846 25 / 107249 10 / 66308 15 / 214987
lung 24 / 128150 19 / 170663 26 / 159917 18 / 159059 24 / 128150 19 / 170663 26 / 159917 18 / 159059
lymph node 30 / 62650 13 / 27007 1047 / 5278419 182 / 4863489 30 / 62650 13 / 27007 1047 / 5278419 182 / 4863489
lymphoreticular   8 / 44303 -- -- 0 / 17836 8 / 44303 -- --
mammary gland 16 / 46553 24 / 104307 4374 / 43166038 3217 / 30312656 16 / 46553 24 / 104307 4374 / 43166038 3217 / 30312656
muscle 16 / 74039 5 / 27691 5 / 107836 12 / 61270 16 / 74039 5 / 27691 5 / 107836 12 / 61270
nervous 7 / 10333   -- -- 7 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   8 / 89988 8 / 94887 15 / 179472 0 / 11462 8 / 89988 8 / 94887 15 / 179472
pancreas   7 / 74930 3 / 85728 5 / 189999 0 / 7237 7 / 74930 3 / 85728 5 / 189999
pancreatic islet 28 / 96524 5 / 30072 -- -- 28 / 96524 5 / 30072 -- --
parathyroid   8 / 20557 -- -- 0 / 24 8 / 20557 -- --
peripheral nervous system 3 / 14891 1 / 645 -- -- 3 / 14891 1 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland 5 / 13260   -- -- 5 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 71 / 241088 1 / 39531 57 / 207348 -- 71 / 241088 1 / 39531 57 / 207348 --
pooled tissue 28 / 276455   -- -- 28 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 10 / 79993 17 / 107080 20 / 266949 51 / 491794 10 / 79993 17 / 107080 20 / 266949 51 / 491794
retina 7 / 29438 -- 122 / 820326 20 / 88490 7 / 29438 -- 122 / 820326 20 / 88490
salivary gland 1 / 2490   -- -- 1 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 24 / 73633 43 / 125377 1192 / 26905847 1551 / 34522313 24 / 73633 43 / 125377 1192 / 26905847 1551 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 7 / 52939   -- -- 7 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 218 / 6230144 -- -- -- 218 / 6230144 --
stomach 3 / 26641 20 / 65644 20 / 124767 63 / 448716 3 / 26641 20 / 65644 20 / 124767 63 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 40 / 143630 59 / 100058 -- 802 / 12372003 40 / 143630 59 / 100058 -- 802 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 3 / 11737 10 / 32606 30 / 115938 63 / 124664 3 / 11737 10 / 32606 30 / 115938 63 / 124664
uncharacterized tissue 52 / 207932 129 / 479819   14 / 51729 52 / 207932 129 / 479819 0 / 21833 14 / 51729
uterus 12 / 38063 64 / 133582 3058 / 10193077 -- 12 / 38063 64 / 133582 3058 / 10193077 --
vascular 14 / 46250 -- 1240 / 13135050 -- 14 / 46250 -- 1240 / 13135050 --
white blood cells -- -- 68 / 846268 -- -- -- 68 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --