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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.279912Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 159 / 3316537 48 / 2498449 599 / 114162531 1322 / 109592465 159 / 3316537 48 / 2498449 599 / 114162531 1322 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   1 / 29891   18 / 4978364 0 / 14774 1 / 29891 0 / 5047110 18 / 4978364
brain 51 / 506301 3 / 200215 12 / 729526 44 / 4997811 51 / 506301 3 / 200215 12 / 729526 44 / 4997811
cartilage     --   0 / 15965 0 / 37226 -- 0 / 778035
cerebellum 9 / 90353   3 / 90885 23 / 1495938 9 / 90353 0 / 0 3 / 90885 23 / 1495938
cerebrum 25 / 198932   -- -- 25 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon     1 / 98089 2 / 643586 0 / 26551 0 / 151167 1 / 98089 2 / 643586
ear 2 / 16130 -- -- -- 2 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 11 / 246043   -- -- 11 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus 1 / 270   -- -- 1 / 270 0 / 17290 -- --
eye 2 / 128826 2 / 46440   779 / 12434232 2 / 128826 2 / 46440 0 / 85898 779 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803     -- 1 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart     1 / 83063 -- 0 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 4 / 106627 3 / 89898 4 / 155372   4 / 106627 3 / 89898 4 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 6 / 96846 1 / 107249   1 / 214987 6 / 96846 1 / 107249 0 / 66308 1 / 214987
lung 5 / 128150 5 / 170663 1 / 159917 4 / 159059 5 / 128150 5 / 170663 1 / 159917 4 / 159059
lymph node 1 / 62650   25 / 5278419 8 / 4863489 1 / 62650 0 / 27007 25 / 5278419 8 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 3 / 46553 8 / 104307 33 / 43166038 251 / 30312656 3 / 46553 8 / 104307 33 / 43166038 251 / 30312656
muscle 8 / 74039       8 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   2 / 89988 1 / 94887   0 / 11462 2 / 89988 1 / 94887 0 / 179472
pancreas         0 / 7237 0 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet 8 / 96524   -- -- 8 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 2 / 13260   -- -- 2 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 3 / 241088     -- 3 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 4 / 276455   -- -- 4 / 276455 0 / 0 -- --
prostate   4 / 107080 1 / 266949 1 / 491794 0 / 79993 4 / 107080 1 / 266949 1 / 491794
retina   -- 8 / 820326 1 / 88490 0 / 29438 -- 8 / 820326 1 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin   2 / 125377 141 / 26905847 123 / 34522313 0 / 73633 2 / 125377 141 / 26905847 123 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 85 / 6230144 -- -- -- 85 / 6230144 --
stomach       1 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 1 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 9 / 143630 5 / 100058 -- 65 / 12372003 9 / 143630 5 / 100058 -- 65 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid       1 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 1 / 124664
uncharacterized tissue 2 / 207932 7 / 479819     2 / 207932 7 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus   5 / 133582 66 / 10193077 -- 0 / 38063 5 / 133582 66 / 10193077 --
vascular   -- 210 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 210 / 13135050 --
white blood cells -- -- 7 / 846268 -- -- -- 7 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --