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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.279594Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 833 / 3316537 542 / 2498449 2288 / 114162531 3214 / 109592465 833 / 3316537 542 / 2498449 2288 / 114162531 3214 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   11 / 57865 -- 1 / 83577 0 / 16077 11 / 57865 -- 1 / 83577
bone marrow   8 / 29891 9 / 5047110 15 / 4978364 0 / 14774 8 / 29891 9 / 5047110 15 / 4978364
brain 111 / 506301 115 / 200215 11 / 729526 237 / 4997811 111 / 506301 115 / 200215 11 / 729526 237 / 4997811
cartilage 30 / 15965 5 / 37226 -- 64 / 778035 30 / 15965 5 / 37226 -- 64 / 778035
cerebellum 7 / 90353   2 / 90885 16 / 1495938 7 / 90353 0 / 0 2 / 90885 16 / 1495938
cerebrum 34 / 198932 3 / 3422 -- -- 34 / 198932 3 / 3422 -- --
cervix 3 / 3888 10 / 44577 -- -- 3 / 3888 10 / 44577 -- --
colon 12 / 26551 7 / 151167 4 / 98089 13 / 643586 12 / 26551 7 / 151167 4 / 98089 13 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 22 / 246043   -- -- 22 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 26 / 19564   -- -- 26 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus 1 / 270 10 / 17290 -- -- 1 / 270 10 / 17290 -- --
eye 13 / 128826   2 / 85898 29 / 12434232 13 / 128826 0 / 46440 2 / 85898 29 / 12434232
gastrointestinal tract 59 / 28803 2 / 12721 2 / 45908 -- 59 / 28803 2 / 12721 2 / 45908 --
heart 13 / 76442   3 / 83063 -- 13 / 76442 0 / 1 3 / 83063 --
kidney 48 / 106627 6 / 89898 3 / 155372 4 / 100281 48 / 106627 6 / 89898 3 / 155372 4 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 2 / 96846 32 / 107249 5 / 66308 3 / 214987 2 / 96846 32 / 107249 5 / 66308 3 / 214987
lung 66 / 128150 14 / 170663 8 / 159917 7 / 159059 66 / 128150 14 / 170663 8 / 159917 7 / 159059
lymph node     61 / 5278419 18 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 61 / 5278419 18 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 3 / 46553 31 / 104307 146 / 43166038 1011 / 30312656 3 / 46553 31 / 104307 146 / 43166038 1011 / 30312656
muscle 2 / 74039 6 / 27691   1 / 61270 2 / 74039 6 / 27691 0 / 107836 1 / 61270
nervous 4 / 10333   -- -- 4 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 7 / 89988 5 / 94887 13 / 179472 1 / 11462 7 / 89988 5 / 94887 13 / 179472
pancreas   6 / 74930 1 / 85728 10 / 189999 0 / 7237 6 / 74930 1 / 85728 10 / 189999
pancreatic islet   1 / 30072 -- -- 0 / 96524 1 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system 8 / 14891   -- -- 8 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 56 / 241088 1 / 39531 10 / 207348 -- 56 / 241088 1 / 39531 10 / 207348 --
pooled tissue 9 / 276455   -- -- 9 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 32 / 79993 10 / 107080 18 / 266949 19 / 491794 32 / 79993 10 / 107080 18 / 266949 19 / 491794
retina 1 / 29438 -- 7 / 820326   1 / 29438 -- 7 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 17 / 73633 9 / 125377 653 / 26905847 791 / 34522313 17 / 73633 9 / 125377 653 / 26905847 791 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 61 / 52939   -- -- 61 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 92 / 6230144 -- -- -- 92 / 6230144 --
stomach 8 / 26641 12 / 65644 3 / 124767 25 / 448716 8 / 26641 12 / 65644 3 / 124767 25 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 20 / 143630 39 / 100058 -- 932 / 12372003 20 / 143630 39 / 100058 -- 932 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 2 / 11737 2 / 32606 9 / 115938 5 / 124664 2 / 11737 2 / 32606 9 / 115938 5 / 124664
uncharacterized tissue 124 / 207932 182 / 479819     124 / 207932 182 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 2 / 38063 12 / 133582 327 / 10193077 -- 2 / 38063 12 / 133582 327 / 10193077 --
vascular 34 / 46250 -- 870 / 13135050 -- 34 / 46250 -- 870 / 13135050 --
white blood cells -- -- 37 / 846268 -- -- -- 37 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --