Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.278436Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 87 / 3316537 28 / 2498449 18028 / 114162531 22119 / 109592465 87 / 3316537 28 / 2498449 18028 / 114162531 22119 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     83 / 5047110 75 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 83 / 5047110 75 / 4978364
brain 29 / 506301 5 / 200215 92 / 729526 660 / 4997811 29 / 506301 5 / 200215 92 / 729526 660 / 4997811
cartilage   2 / 37226 -- 49 / 778035 0 / 15965 2 / 37226 -- 49 / 778035
cerebellum     9 / 90885 133 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 9 / 90885 133 / 1495938
cerebrum 1 / 198932   -- -- 1 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon     2 / 98089 63 / 643586 0 / 26551 0 / 151167 2 / 98089 63 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 3 / 246043   -- -- 3 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 3 / 128826   3 / 85898 2289 / 12434232 3 / 128826 0 / 46440 3 / 85898 2289 / 12434232
gastrointestinal tract     2 / 45908 -- 0 / 28803 0 / 12721 2 / 45908 --
heart     6 / 83063 -- 0 / 76442 0 / 1 6 / 83063 --
kidney 1 / 106627 2 / 89898 12 / 155372 25 / 100281 1 / 106627 2 / 89898 12 / 155372 25 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver     3 / 66308 20 / 214987 0 / 96846 0 / 107249 3 / 66308 20 / 214987
lung 7 / 128150   13 / 159917 5 / 159059 7 / 128150 0 / 170663 13 / 159917 5 / 159059
lymph node     532 / 5278419 141 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 532 / 5278419 141 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 2 / 46553 3 / 104307 1271 / 43166038 13243 / 30312656 2 / 46553 3 / 104307 1271 / 43166038 13243 / 30312656
muscle 1 / 74039 1 / 27691 1 / 107836 4 / 61270 1 / 74039 1 / 27691 1 / 107836 4 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary     10 / 94887 10 / 179472 0 / 11462 0 / 89988 10 / 94887 10 / 179472
pancreas   2 / 74930 1 / 85728 10 / 189999 0 / 7237 2 / 74930 1 / 85728 10 / 189999
pancreatic islet 5 / 96524   -- -- 5 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   2 / 20557 -- -- 0 / 24 2 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta     29 / 207348 -- 0 / 241088 0 / 39531 29 / 207348 --
pooled tissue 8 / 276455   -- -- 8 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 2 / 79993 2 / 107080 23 / 266949 34 / 491794 2 / 79993 2 / 107080 23 / 266949 34 / 491794
retina   -- 102 / 820326 14 / 88490 0 / 29438 -- 102 / 820326 14 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 2 / 73633   3517 / 26905847 3992 / 34522313 2 / 73633 0 / 125377 3517 / 26905847 3992 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 673 / 6230144 -- -- -- 673 / 6230144 --
stomach   1 / 65644 6 / 124767 30 / 448716 0 / 26641 1 / 65644 6 / 124767 30 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis   3 / 100058 -- 1296 / 12372003 0 / 143630 3 / 100058 -- 1296 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     15 / 115938 19 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 15 / 115938 19 / 124664
uncharacterized tissue 1 / 207932 4 / 479819 1 / 21833 7 / 51729 1 / 207932 4 / 479819 1 / 21833 7 / 51729
uterus 10 / 38063 1 / 133582 1198 / 10193077 -- 10 / 38063 1 / 133582 1198 / 10193077 --
vascular 10 / 46250 -- 10367 / 13135050 -- 10 / 46250 -- 10367 / 13135050 --
white blood cells -- -- 57 / 846268 -- -- -- 57 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --