Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.273621Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 1367 / 3316537 451 / 2498449 1225 / 114162531 2651 / 109592465 1367 / 3316537 451 / 2498449 1225 / 114162531 2651 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 3 / 16077 11 / 57865 --   3 / 16077 11 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   2 / 29891 6 / 5047110 2 / 4978364 0 / 14774 2 / 29891 6 / 5047110 2 / 4978364
brain 562 / 506301 58 / 200215 138 / 729526 560 / 4997811 562 / 506301 58 / 200215 138 / 729526 560 / 4997811
cartilage 3 / 15965 5 / 37226 -- 8 / 778035 3 / 15965 5 / 37226 -- 8 / 778035
cerebellum 46 / 90353   6 / 90885 136 / 1495938 46 / 90353 0 / 0 6 / 90885 136 / 1495938
cerebrum 497 / 198932 1 / 3422 -- -- 497 / 198932 1 / 3422 -- --
cervix   8 / 44577 -- -- 0 / 3888 8 / 44577 -- --
colon 3 / 26551 9 / 151167 1 / 98089 13 / 643586 3 / 26551 9 / 151167 1 / 98089 13 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 18 / 246043   -- -- 18 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 3 / 19564   -- -- 3 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   6 / 17290 -- -- 0 / 270 6 / 17290 -- --
eye 13 / 128826 11 / 46440 1 / 85898 86 / 12434232 13 / 128826 11 / 46440 1 / 85898 86 / 12434232
gastrointestinal tract 2 / 28803 1 / 12721   -- 2 / 28803 1 / 12721 0 / 45908 --
heart 5 / 76442   2 / 83063 -- 5 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney 14 / 106627 63 / 89898 4 / 155372 18 / 100281 14 / 106627 63 / 89898 4 / 155372 18 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 1 / 96846 17 / 107249 1 / 66308 7 / 214987 1 / 96846 17 / 107249 1 / 66308 7 / 214987
lung 7 / 128150 10 / 170663 4 / 159917 2 / 159059 7 / 128150 10 / 170663 4 / 159917 2 / 159059
lymph node 5 / 62650 1 / 27007 172 / 5278419 94 / 4863489 5 / 62650 1 / 27007 172 / 5278419 94 / 4863489
lymphoreticular 4 / 17836 1 / 44303 -- -- 4 / 17836 1 / 44303 -- --
mammary gland 2 / 46553 9 / 104307 24 / 43166038 825 / 30312656 2 / 46553 9 / 104307 24 / 43166038 825 / 30312656
muscle 4 / 74039 2 / 27691     4 / 74039 2 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous 6 / 10333   -- -- 6 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   7 / 89988 12 / 94887 10 / 179472 0 / 11462 7 / 89988 12 / 94887 10 / 179472
pancreas   3 / 74930   4 / 189999 0 / 7237 3 / 74930 0 / 85728 4 / 189999
pancreatic islet   3 / 30072 -- -- 0 / 96524 3 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 24 / 241088 3 / 39531 13 / 207348 -- 24 / 241088 3 / 39531 13 / 207348 --
pooled tissue 21 / 276455   -- -- 21 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 11 / 79993 16 / 107080 14 / 266949 29 / 491794 11 / 79993 16 / 107080 14 / 266949 29 / 491794
retina 14 / 29438 -- 45 / 820326 2 / 88490 14 / 29438 -- 45 / 820326 2 / 88490
salivary gland 1 / 2490 6 / 10368 -- -- 1 / 2490 6 / 10368 -- --
skin 25 / 73633 61 / 125377 318 / 26905847 645 / 34522313 25 / 73633 61 / 125377 318 / 26905847 645 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 7 / 52939   -- -- 7 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 41 / 6230144 -- -- -- 41 / 6230144 --
stomach   10 / 65644 1 / 124767 14 / 448716 0 / 26641 10 / 65644 1 / 124767 14 / 448716
synovium   1 / 1650 -- -- 0 / 249 1 / 1650 -- --
testis 14 / 143630 13 / 100058 -- 185 / 12372003 14 / 143630 13 / 100058 -- 185 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 4 / 11737 4 / 32606 6 / 115938 8 / 124664 4 / 11737 4 / 32606 6 / 115938 8 / 124664
uncharacterized tissue 31 / 207932 74 / 479819 1 / 21833 3 / 51729 31 / 207932 74 / 479819 1 / 21833 3 / 51729
uterus 1 / 38063 34 / 133582 113 / 10193077 -- 1 / 38063 34 / 133582 113 / 10193077 --
vascular 11 / 46250 -- 283 / 13135050 -- 11 / 46250 -- 283 / 13135050 --
white blood cells -- -- 19 / 846268 -- -- -- 19 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --