Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.272350Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES   1 / 2498449 651 / 114162531 934 / 109592465 0 / 3316537 1 / 2498449 651 / 114162531 934 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   1 / 57865 --   0 / 16077 1 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     18 / 5047110 3 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 18 / 5047110 3 / 4978364
brain     15 / 729526 71 / 4997811 0 / 506301 0 / 200215 15 / 729526 71 / 4997811
cartilage     -- 3 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 3 / 778035
cerebellum     1 / 90885 20 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 1 / 90885 20 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon         0 / 26551 0 / 151167 0 / 98089 0 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue     -- -- 0 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye       129 / 12434232 0 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 129 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart     2 / 83063 -- 0 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney     1 / 155372 2 / 100281 0 / 106627 0 / 89898 1 / 155372 2 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver     1 / 66308   0 / 96846 0 / 107249 1 / 66308 0 / 214987
lung         0 / 128150 0 / 170663 0 / 159917 0 / 159059
lymph node     12 / 5278419 7 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 12 / 5278419 7 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland     88 / 43166038 211 / 30312656 0 / 46553 0 / 104307 88 / 43166038 211 / 30312656
muscle     2 / 107836 1 / 61270 0 / 74039 0 / 27691 2 / 107836 1 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary       1 / 179472 0 / 11462 0 / 89988 0 / 94887 1 / 179472
pancreas     1 / 85728   0 / 7237 0 / 74930 1 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta       -- 0 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue     -- -- 0 / 276455 0 / 0 -- --
prostate       1 / 491794 0 / 79993 0 / 107080 0 / 266949 1 / 491794
retina   -- 25 / 820326   0 / 29438 -- 25 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin     301 / 26905847 188 / 34522313 0 / 73633 0 / 125377 301 / 26905847 188 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 34 / 6230144 -- -- -- 34 / 6230144 --
stomach     1 / 124767   0 / 26641 0 / 65644 1 / 124767 0 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis     -- 295 / 12372003 0 / 143630 0 / 100058 -- 295 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid       2 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue         0 / 207932 0 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus     104 / 10193077 -- 0 / 38063 0 / 133582 104 / 10193077 --
vascular   -- 45 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 45 / 13135050 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --