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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.271643Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 257 / 3316537 156 / 2498449 3407 / 114162531 4925 / 109592465 257 / 3316537 156 / 2498449 3407 / 114162531 4925 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 1 / 14774 2 / 29891 27 / 5047110 64 / 4978364 1 / 14774 2 / 29891 27 / 5047110 64 / 4978364
brain 55 / 506301 20 / 200215 14 / 729526 178 / 4997811 55 / 506301 20 / 200215 14 / 729526 178 / 4997811
cartilage   3 / 37226 -- 10 / 778035 0 / 15965 3 / 37226 -- 10 / 778035
cerebellum 1 / 90353   2 / 90885 44 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 2 / 90885 44 / 1495938
cerebrum 33 / 198932   -- -- 33 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 4 / 151167 1 / 98089   2 / 26551 4 / 151167 1 / 98089 0 / 643586
ear 3 / 16130 -- -- -- 3 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 8 / 246043   -- -- 8 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 10 / 19564 1 / 2857 -- -- 10 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus   2 / 17290 -- -- 0 / 270 2 / 17290 -- --
eye 5 / 128826 1 / 46440 2 / 85898 1725 / 12434232 5 / 128826 1 / 46440 2 / 85898 1725 / 12434232
gastrointestinal tract 4 / 28803     -- 4 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 2 / 76442   1 / 83063 -- 2 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 6 / 106627 7 / 89898 4 / 155372   6 / 106627 7 / 89898 4 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 4 / 96846 7 / 107249 2 / 66308 1 / 214987 4 / 96846 7 / 107249 2 / 66308 1 / 214987
lung 6 / 128150 5 / 170663 4 / 159917 3 / 159059 6 / 128150 5 / 170663 4 / 159917 3 / 159059
lymph node 6 / 62650 2 / 27007 203 / 5278419 73 / 4863489 6 / 62650 2 / 27007 203 / 5278419 73 / 4863489
lymphoreticular   1 / 44303 -- -- 0 / 17836 1 / 44303 -- --
mammary gland   4 / 104307 30 / 43166038 1415 / 30312656 0 / 46553 4 / 104307 30 / 43166038 1415 / 30312656
muscle 9 / 74039   1 / 107836   9 / 74039 0 / 27691 1 / 107836 0 / 61270
nervous 2 / 10333   -- -- 2 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   1 / 89988   3 / 179472 0 / 11462 1 / 89988 0 / 94887 3 / 179472
pancreas   2 / 74930   5 / 189999 0 / 7237 2 / 74930 0 / 85728 5 / 189999
pancreatic islet 23 / 96524 4 / 30072 -- -- 23 / 96524 4 / 30072 -- --
parathyroid   9 / 20557 -- -- 0 / 24 9 / 20557 -- --
peripheral nervous system 3 / 14891   -- -- 3 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 22 / 241088   9 / 207348 -- 22 / 241088 0 / 39531 9 / 207348 --
pooled tissue 5 / 276455   -- -- 5 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 2 / 79993 5 / 107080 6 / 266949 6 / 491794 2 / 79993 5 / 107080 6 / 266949 6 / 491794
retina   -- 50 / 820326 5 / 88490 0 / 29438 -- 50 / 820326 5 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin   4 / 125377 2007 / 26905847 1274 / 34522313 0 / 73633 4 / 125377 2007 / 26905847 1274 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 5 / 52939   -- -- 5 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 75 / 6230144 -- -- -- 75 / 6230144 --
stomach   2 / 65644 3 / 124767 12 / 448716 0 / 26641 2 / 65644 3 / 124767 12 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 9 / 143630 1 / 100058 -- 90 / 12372003 9 / 143630 1 / 100058 -- 90 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737 7 / 32606 8 / 115938 14 / 124664 1 / 11737 7 / 32606 8 / 115938 14 / 124664
uncharacterized tissue 15 / 207932 57 / 479819   3 / 51729 15 / 207932 57 / 479819 0 / 21833 3 / 51729
uterus 5 / 38063 5 / 133582 433 / 10193077 -- 5 / 38063 5 / 133582 433 / 10193077 --
vascular 7 / 46250 -- 507 / 13135050 -- 7 / 46250 -- 507 / 13135050 --
white blood cells -- -- 18 / 846268 -- -- -- 18 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --