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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.270291Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 422 / 3316537 636 / 2498449 12837 / 114162531 8706 / 109592465 422 / 3316537 636 / 2498449 12837 / 114162531 8706 / 109592465
adrenal cortex -- 2 / 9928 -- -- -- 2 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 4 / 16077 20 / 57865 -- 57 / 83577 4 / 16077 20 / 57865 -- 57 / 83577
bone marrow 1 / 14774 9 / 29891 24 / 5047110 18 / 4978364 1 / 14774 9 / 29891 24 / 5047110 18 / 4978364
brain 20 / 506301 22 / 200215 145 / 729526 564 / 4997811 20 / 506301 22 / 200215 145 / 729526 564 / 4997811
cartilage   10 / 37226 -- 258 / 778035 0 / 15965 10 / 37226 -- 258 / 778035
cerebellum 1 / 90353   2 / 90885 42 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 2 / 90885 42 / 1495938
cerebrum 9 / 198932   -- -- 9 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   6 / 44577 -- -- 0 / 3888 6 / 44577 -- --
colon 8 / 26551 67 / 151167 157 / 98089 311 / 643586 8 / 26551 67 / 151167 157 / 98089 311 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 81 / 246043   -- -- 81 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   3 / 17290 -- -- 0 / 270 3 / 17290 -- --
eye 34 / 128826 4 / 46440 6 / 85898 845 / 12434232 34 / 128826 4 / 46440 6 / 85898 845 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803   5 / 45908 -- 1 / 28803 0 / 12721 5 / 45908 --
heart 5 / 76442   4 / 83063 -- 5 / 76442 0 / 1 4 / 83063 --
kidney 9 / 106627 22 / 89898 106 / 155372 28 / 100281 9 / 106627 22 / 89898 106 / 155372 28 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 13 / 96846 22 / 107249   31 / 214987 13 / 96846 22 / 107249 0 / 66308 31 / 214987
lung 16 / 128150 54 / 170663 54 / 159917 29 / 159059 16 / 128150 54 / 170663 54 / 159917 29 / 159059
lymph node 15 / 62650   116 / 5278419 12 / 4863489 15 / 62650 0 / 27007 116 / 5278419 12 / 4863489
lymphoreticular   1 / 44303 -- -- 0 / 17836 1 / 44303 -- --
mammary gland 14 / 46553 49 / 104307 8531 / 43166038 4191 / 30312656 14 / 46553 49 / 104307 8531 / 43166038 4191 / 30312656
muscle 7 / 74039   1 / 107836 13 / 61270 7 / 74039 0 / 27691 1 / 107836 13 / 61270
nervous 3 / 10333   -- -- 3 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 22 / 89988 47 / 94887 117 / 179472 1 / 11462 22 / 89988 47 / 94887 117 / 179472
pancreas   53 / 74930 15 / 85728 196 / 189999 0 / 7237 53 / 74930 15 / 85728 196 / 189999
pancreatic islet 10 / 96524 5 / 30072 -- -- 10 / 96524 5 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system 5 / 14891 1 / 645 -- -- 5 / 14891 1 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 39 / 241088 15 / 39531 9 / 207348 -- 39 / 241088 15 / 39531 9 / 207348 --
pooled tissue 22 / 276455   -- -- 22 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 20 / 79993 52 / 107080 16 / 266949 98 / 491794 20 / 79993 52 / 107080 16 / 266949 98 / 491794
retina 2 / 29438 -- 29 / 820326 3 / 88490 2 / 29438 -- 29 / 820326 3 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 21 / 73633 40 / 125377 1760 / 26905847 1384 / 34522313 21 / 73633 40 / 125377 1760 / 26905847 1384 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 5 / 52939   -- -- 5 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 395 / 6230144 -- -- -- 395 / 6230144 --
stomach   18 / 65644 5 / 124767 198 / 448716 0 / 26641 18 / 65644 5 / 124767 198 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 2 / 143630   -- 299 / 12372003 2 / 143630 0 / 100058 -- 299 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 7 / 11737 15 / 32606 5 / 115938 10 / 124664 7 / 11737 15 / 32606 5 / 115938 10 / 124664
uncharacterized tissue 33 / 207932 90 / 479819 20 / 21833 2 / 51729 33 / 207932 90 / 479819 20 / 21833 2 / 51729
uterus 8 / 38063 33 / 133582 372 / 10193077 -- 8 / 38063 33 / 133582 372 / 10193077 --
vascular 2 / 46250 -- 842 / 13135050 -- 2 / 46250 -- 842 / 13135050 --
white blood cells -- -- 171 / 846268 -- -- -- 171 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --