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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.25544Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 110 / 3316537 93 / 2498449 1031 / 114162531 364 / 109592465 110 / 3316537 93 / 2498449 1031 / 114162531 364 / 109592465
adrenal cortex -- 2 / 9928 -- -- -- 2 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   8 / 57865 -- 3 / 83577 0 / 16077 8 / 57865 -- 3 / 83577
bone marrow   1 / 29891 7 / 5047110   0 / 14774 1 / 29891 7 / 5047110 0 / 4978364
brain 17 / 506301 9 / 200215 6 / 729526 27 / 4997811 17 / 506301 9 / 200215 6 / 729526 27 / 4997811
cartilage 1 / 15965 1 / 37226 -- 12 / 778035 1 / 15965 1 / 37226 -- 12 / 778035
cerebellum 1 / 90353     4 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 0 / 90885 4 / 1495938
cerebrum 3 / 198932   -- -- 3 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 1 / 3888 3 / 44577 -- -- 1 / 3888 3 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 3 / 151167   14 / 643586 2 / 26551 3 / 151167 0 / 98089 14 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 7 / 246043   -- -- 7 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 4 / 128826 2 / 46440 2 / 85898 104 / 12434232 4 / 128826 2 / 46440 2 / 85898 104 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart       -- 0 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 1 / 106627   2 / 155372 2 / 100281 1 / 106627 0 / 89898 2 / 155372 2 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 3 / 96846 2 / 107249 1 / 66308 3 / 214987 3 / 96846 2 / 107249 1 / 66308 3 / 214987
lung 6 / 128150 5 / 170663 1 / 159917 5 / 159059 6 / 128150 5 / 170663 1 / 159917 5 / 159059
lymph node 2 / 62650   20 / 5278419   2 / 62650 0 / 27007 20 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular 1 / 17836   -- -- 1 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 3 / 46553   674 / 43166038 118 / 30312656 3 / 46553 0 / 104307 674 / 43166038 118 / 30312656
muscle 2 / 74039   1 / 107836   2 / 74039 0 / 27691 1 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 2 / 11462 8 / 89988 3 / 94887 3 / 179472 2 / 11462 8 / 89988 3 / 94887 3 / 179472
pancreas   5 / 74930   3 / 189999 0 / 7237 5 / 74930 0 / 85728 3 / 189999
pancreatic islet 2 / 96524   -- -- 2 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 19 / 241088     -- 19 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 14 / 276455   -- -- 14 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 1 / 79993   2 / 266949   1 / 79993 0 / 107080 2 / 266949 0 / 491794
retina   -- 2 / 820326   0 / 29438 -- 2 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin   10 / 125377 36 / 26905847 31 / 34522313 0 / 73633 10 / 125377 36 / 26905847 31 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 24 / 6230144 -- -- -- 24 / 6230144 --
stomach         0 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 0 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 8 / 143630 4 / 100058 -- 35 / 12372003 8 / 143630 4 / 100058 -- 35 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   1 / 32606     0 / 11737 1 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 6 / 207932 26 / 479819 1 / 21833   6 / 207932 26 / 479819 1 / 21833 0 / 51729
uterus 3 / 38063 3 / 133582 41 / 10193077 -- 3 / 38063 3 / 133582 41 / 10193077 --
vascular   -- 198 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 198 / 13135050 --
white blood cells -- -- 10 / 846268 -- -- -- 10 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --