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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.25527Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 47 / 3316537 78 / 2498449 698 / 114162531 1064 / 109592465 47 / 3316537 78 / 2498449 698 / 114162531 1064 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   1 / 57865 --   0 / 16077 1 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow         0 / 14774 0 / 29891 0 / 5047110 0 / 4978364
brain 1 / 506301       1 / 506301 0 / 200215 0 / 729526 0 / 4997811
cartilage   1 / 37226 --   0 / 15965 1 / 37226 -- 0 / 778035
cerebellum       1 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 1 / 1495938
cerebrum 1 / 198932   -- -- 1 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   2 / 44577 -- -- 0 / 3888 2 / 44577 -- --
colon 3 / 26551 10 / 151167 27 / 98089 23 / 643586 3 / 26551 10 / 151167 27 / 98089 23 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 7 / 246043   -- -- 7 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 1 / 128826 9 / 46440 1 / 85898 600 / 12434232 1 / 128826 9 / 46440 1 / 85898 600 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803   1 / 45908 -- 1 / 28803 0 / 12721 1 / 45908 --
heart       -- 0 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney       1 / 100281 0 / 106627 0 / 89898 0 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver   2 / 107249 2 / 66308   0 / 96846 2 / 107249 2 / 66308 0 / 214987
lung 4 / 128150 1 / 170663   3 / 159059 4 / 128150 1 / 170663 0 / 159917 3 / 159059
lymph node     4 / 5278419   0 / 62650 0 / 27007 4 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular   1 / 44303 -- -- 0 / 17836 1 / 44303 -- --
mammary gland 3 / 46553 3 / 104307 406 / 43166038 302 / 30312656 3 / 46553 3 / 104307 406 / 43166038 302 / 30312656
muscle         0 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   19 / 89988   2 / 179472 0 / 11462 19 / 89988 0 / 94887 2 / 179472
pancreas   1 / 74930   21 / 189999 0 / 7237 1 / 74930 0 / 85728 21 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 6 / 241088 2 / 39531 2 / 207348 -- 6 / 241088 2 / 39531 2 / 207348 --
pooled tissue 10 / 276455   -- -- 10 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 2 / 79993 2 / 107080   5 / 491794 2 / 79993 2 / 107080 0 / 266949 5 / 491794
retina   --   1 / 88490 0 / 29438 -- 0 / 820326 1 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin     54 / 26905847 16 / 34522313 0 / 73633 0 / 125377 54 / 26905847 16 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 56 / 6230144 -- -- -- 56 / 6230144 --
stomach   3 / 65644 2 / 124767 13 / 448716 0 / 26641 3 / 65644 2 / 124767 13 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 3 / 143630 2 / 100058 -- 76 / 12372003 3 / 143630 2 / 100058 -- 76 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 2 / 11737       2 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 2 / 207932 13 / 479819     2 / 207932 13 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus   5 / 133582 143 / 10193077 -- 0 / 38063 5 / 133582 143 / 10193077 --
vascular   --   -- 0 / 46250 -- 0 / 13135050 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --