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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.253726Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 460 / 3316537 388 / 2498449 8096 / 114162531 9263 / 109592465 460 / 3316537 388 / 2498449 8096 / 114162531 9263 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077 13 / 57865 --   1 / 16077 13 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 4 / 14774 2 / 29891 54 / 5047110 406 / 4978364 4 / 14774 2 / 29891 54 / 5047110 406 / 4978364
brain 76 / 506301 30 / 200215 29 / 729526 343 / 4997811 76 / 506301 30 / 200215 29 / 729526 343 / 4997811
cartilage 1 / 15965 3 / 37226 -- 31 / 778035 1 / 15965 3 / 37226 -- 31 / 778035
cerebellum 12 / 90353     140 / 1495938 12 / 90353 0 / 0 0 / 90885 140 / 1495938
cerebrum 16 / 198932   -- -- 16 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   16 / 44577 -- -- 0 / 3888 16 / 44577 -- --
colon 3 / 26551 23 / 151167 7 / 98089 33 / 643586 3 / 26551 23 / 151167 7 / 98089 33 / 643586
ear 6 / 16130 -- -- -- 6 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 54 / 246043   -- -- 54 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   2 / 17290 -- -- 0 / 270 2 / 17290 -- --
eye 24 / 128826 10 / 46440 8 / 85898 1534 / 12434232 24 / 128826 10 / 46440 8 / 85898 1534 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803 4 / 12721   -- 1 / 28803 4 / 12721 0 / 45908 --
heart 2 / 76442   1 / 83063 -- 2 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 17 / 106627 7 / 89898 10 / 155372 6 / 100281 17 / 106627 7 / 89898 10 / 155372 6 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 2 / 96846 12 / 107249 7 / 66308 14 / 214987 2 / 96846 12 / 107249 7 / 66308 14 / 214987
lung 13 / 128150 15 / 170663 11 / 159917 9 / 159059 13 / 128150 15 / 170663 11 / 159917 9 / 159059
lymph node 18 / 62650 4 / 27007 613 / 5278419 110 / 4863489 18 / 62650 4 / 27007 613 / 5278419 110 / 4863489
lymphoreticular 1 / 17836 4 / 44303 -- -- 1 / 17836 4 / 44303 -- --
mammary gland 14 / 46553 23 / 104307 2534 / 43166038 2741 / 30312656 14 / 46553 23 / 104307 2534 / 43166038 2741 / 30312656
muscle 13 / 74039 1 / 27691 1 / 107836 1 / 61270 13 / 74039 1 / 27691 1 / 107836 1 / 61270
nervous 2 / 10333   -- -- 2 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 7 / 89988 10 / 94887 14 / 179472 1 / 11462 7 / 89988 10 / 94887 14 / 179472
pancreas   2 / 74930 4 / 85728 16 / 189999 0 / 7237 2 / 74930 4 / 85728 16 / 189999
pancreatic islet 10 / 96524 4 / 30072 -- -- 10 / 96524 4 / 30072 -- --
parathyroid   2 / 20557 -- -- 0 / 24 2 / 20557 -- --
peripheral nervous system 3 / 14891   -- -- 3 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 2 / 13260   -- -- 2 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 34 / 241088 10 / 39531 22 / 207348 -- 34 / 241088 10 / 39531 22 / 207348 --
pooled tissue 36 / 276455   -- -- 36 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 11 / 79993 11 / 107080 7 / 266949 32 / 491794 11 / 79993 11 / 107080 7 / 266949 32 / 491794
retina   -- 46 / 820326 9 / 88490 0 / 29438 -- 46 / 820326 9 / 88490
salivary gland   1 / 10368 -- -- 0 / 2490 1 / 10368 -- --
skin 8 / 73633 13 / 125377 1807 / 26905847 2680 / 34522313 8 / 73633 13 / 125377 1807 / 26905847 2680 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 2 / 52939   -- -- 2 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 516 / 6230144 -- -- -- 516 / 6230144 --
stomach 1 / 26641 10 / 65644 16 / 124767 38 / 448716 1 / 26641 10 / 65644 16 / 124767 38 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 49 / 143630 35 / 100058 -- 1085 / 12372003 49 / 143630 35 / 100058 -- 1085 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737 16 / 32606 10 / 115938 16 / 124664 1 / 11737 16 / 32606 10 / 115938 16 / 124664
uncharacterized tissue 18 / 207932 76 / 479819 4 / 21833 5 / 51729 18 / 207932 76 / 479819 4 / 21833 5 / 51729
uterus 1 / 38063 32 / 133582 1382 / 10193077 -- 1 / 38063 32 / 133582 1382 / 10193077 --
vascular 2 / 46250 -- 948 / 13135050 -- 2 / 46250 -- 948 / 13135050 --
white blood cells -- -- 49 / 846268 -- -- -- 49 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --