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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.2533Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 679 / 3316537 282 / 2498449 2805 / 114162531 2619 / 109592465 679 / 3316537 282 / 2498449 2805 / 114162531 2619 / 109592465
adrenal cortex -- 2 / 9928 -- -- -- 2 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   3 / 57865 --   0 / 16077 3 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 1 / 14774 5 / 29891 58 / 5047110 53 / 4978364 1 / 14774 5 / 29891 58 / 5047110 53 / 4978364
brain 88 / 506301 27 / 200215 10 / 729526 145 / 4997811 88 / 506301 27 / 200215 10 / 729526 145 / 4997811
cartilage 10 / 15965 5 / 37226 -- 16 / 778035 10 / 15965 5 / 37226 -- 16 / 778035
cerebellum 28 / 90353   2 / 90885 19 / 1495938 28 / 90353 0 / 0 2 / 90885 19 / 1495938
cerebrum 50 / 198932   -- -- 50 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 4 / 3888 8 / 44577 -- -- 4 / 3888 8 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 10 / 151167   8 / 643586 2 / 26551 10 / 151167 0 / 98089 8 / 643586
ear 3 / 16130 -- -- -- 3 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 20 / 246043   -- -- 20 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 8 / 19564   -- -- 8 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   3 / 17290 -- -- 0 / 270 3 / 17290 -- --
eye 19 / 128826 2 / 46440   550 / 12434232 19 / 128826 2 / 46440 0 / 85898 550 / 12434232
gastrointestinal tract 20 / 28803 2 / 12721 1 / 45908 -- 20 / 28803 2 / 12721 1 / 45908 --
heart 13 / 76442     -- 13 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 54 / 106627 8 / 89898 5 / 155372 2 / 100281 54 / 106627 8 / 89898 5 / 155372 2 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 18 / 96846 14 / 107249 1 / 66308 1 / 214987 18 / 96846 14 / 107249 1 / 66308 1 / 214987
lung 26 / 128150 11 / 170663 2 / 159917 3 / 159059 26 / 128150 11 / 170663 2 / 159917 3 / 159059
lymph node 2 / 62650   64 / 5278419 24 / 4863489 2 / 62650 0 / 27007 64 / 5278419 24 / 4863489
lymphoreticular   1 / 44303 -- -- 0 / 17836 1 / 44303 -- --
mammary gland 26 / 46553 15 / 104307 826 / 43166038 1026 / 30312656 26 / 46553 15 / 104307 826 / 43166038 1026 / 30312656
muscle 11 / 74039   3 / 107836   11 / 74039 0 / 27691 3 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 3 / 89988 1 / 94887 5 / 179472 1 / 11462 3 / 89988 1 / 94887 5 / 179472
pancreas 2 / 7237 3 / 74930 1 / 85728   2 / 7237 3 / 74930 1 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet 7 / 96524   -- -- 7 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   3 / 20557 -- -- 0 / 24 3 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 24 / 241088 3 / 39531 2 / 207348 -- 24 / 241088 3 / 39531 2 / 207348 --
pooled tissue 37 / 276455   -- -- 37 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 18 / 79993 16 / 107080 5 / 266949 15 / 491794 18 / 79993 16 / 107080 5 / 266949 15 / 491794
retina 1 / 29438 -- 9 / 820326 1 / 88490 1 / 29438 -- 9 / 820326 1 / 88490
salivary gland   2 / 10368 -- -- 0 / 2490 2 / 10368 -- --
skin 24 / 73633 5 / 125377 938 / 26905847 429 / 34522313 24 / 73633 5 / 125377 938 / 26905847 429 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 16 / 52939   -- -- 16 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 237 / 6230144 -- -- -- 237 / 6230144 --
stomach 6 / 26641 4 / 65644 4 / 124767 10 / 448716 6 / 26641 4 / 65644 4 / 124767 10 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 74 / 143630 18 / 100058 -- 304 / 12372003 74 / 143630 18 / 100058 -- 304 / 12372003
thymus 2 / 4478   -- -- 2 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   19 / 32606 5 / 115938 8 / 124664 0 / 11737 19 / 32606 5 / 115938 8 / 124664
uncharacterized tissue 42 / 207932 77 / 479819 2 / 21833   42 / 207932 77 / 479819 2 / 21833 0 / 51729
uterus 4 / 38063 13 / 133582 234 / 10193077 -- 4 / 38063 13 / 133582 234 / 10193077 --
vascular 9 / 46250 -- 381 / 13135050 -- 9 / 46250 -- 381 / 13135050 --
white blood cells -- -- 14 / 846268 -- -- -- 14 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --