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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.250758Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 313 / 3316537 652 / 2498449 8817 / 114162531 11091 / 109592465 313 / 3316537 652 / 2498449 8817 / 114162531 11091 / 109592465
adrenal cortex -- 3 / 9928 -- -- -- 3 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 8 / 16077 11 / 57865 -- 15 / 83577 8 / 16077 11 / 57865 -- 15 / 83577
bone marrow   7 / 29891 363 / 5047110 258 / 4978364 0 / 14774 7 / 29891 363 / 5047110 258 / 4978364
brain 35 / 506301 36 / 200215 71 / 729526 521 / 4997811 35 / 506301 36 / 200215 71 / 729526 521 / 4997811
cartilage   4 / 37226 -- 77 / 778035 0 / 15965 4 / 37226 -- 77 / 778035
cerebellum 7 / 90353   15 / 90885 135 / 1495938 7 / 90353 0 / 0 15 / 90885 135 / 1495938
cerebrum 6 / 198932 1 / 3422 -- -- 6 / 198932 1 / 3422 -- --
cervix   27 / 44577 -- -- 0 / 3888 27 / 44577 -- --
colon 3 / 26551 22 / 151167 6 / 98089 70 / 643586 3 / 26551 22 / 151167 6 / 98089 70 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 67 / 246043   -- -- 67 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564   -- -- 1 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   9 / 17290 -- -- 0 / 270 9 / 17290 -- --
eye 18 / 128826 15 / 46440 14 / 85898 2152 / 12434232 18 / 128826 15 / 46440 14 / 85898 2152 / 12434232
gastrointestinal tract   6 / 12721 2 / 45908 -- 0 / 28803 6 / 12721 2 / 45908 --
heart 8 / 76442   8 / 83063 -- 8 / 76442 0 / 1 8 / 83063 --
kidney 11 / 106627 16 / 89898 13 / 155372 2 / 100281 11 / 106627 16 / 89898 13 / 155372 2 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 11 / 96846 41 / 107249 10 / 66308 13 / 214987 11 / 96846 41 / 107249 10 / 66308 13 / 214987
lung 4 / 128150 72 / 170663 11 / 159917 14 / 159059 4 / 128150 72 / 170663 11 / 159917 14 / 159059
lymph node 6 / 62650 1 / 27007 157 / 5278419 88 / 4863489 6 / 62650 1 / 27007 157 / 5278419 88 / 4863489
lymphoreticular 4 / 17836 40 / 44303 -- -- 4 / 17836 40 / 44303 -- --
mammary gland 4 / 46553 30 / 104307 1955 / 43166038 3558 / 30312656 4 / 46553 30 / 104307 1955 / 43166038 3558 / 30312656
muscle 18 / 74039 8 / 27691 11 / 107836 5 / 61270 18 / 74039 8 / 27691 11 / 107836 5 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 2 / 11462 23 / 89988 11 / 94887 24 / 179472 2 / 11462 23 / 89988 11 / 94887 24 / 179472
pancreas   17 / 74930 2 / 85728 28 / 189999 0 / 7237 17 / 74930 2 / 85728 28 / 189999
pancreatic islet 1 / 96524 4 / 30072 -- -- 1 / 96524 4 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 3 / 14891 1 / 645 -- -- 3 / 14891 1 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 21 / 241088 19 / 39531 16 / 207348 -- 21 / 241088 19 / 39531 16 / 207348 --
pooled tissue 13 / 276455   -- -- 13 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 6 / 79993 42 / 107080 26 / 266949 50 / 491794 6 / 79993 42 / 107080 26 / 266949 50 / 491794
retina 3 / 29438 -- 69 / 820326 21 / 88490 3 / 29438 -- 69 / 820326 21 / 88490
salivary gland   18 / 10368 -- -- 0 / 2490 18 / 10368 -- --
skin 5 / 73633 48 / 125377 2320 / 26905847 2431 / 34522313 5 / 73633 48 / 125377 2320 / 26905847 2431 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 2 / 52939   -- -- 2 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 1072 / 6230144 -- -- -- 1072 / 6230144 --
stomach 2 / 26641 13 / 65644 9 / 124767 37 / 448716 2 / 26641 13 / 65644 9 / 124767 37 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 2 / 143630 5 / 100058 -- 1574 / 12372003 2 / 143630 5 / 100058 -- 1574 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 2 / 11737 11 / 32606 3 / 115938 11 / 124664 2 / 11737 11 / 32606 3 / 115938 11 / 124664
uncharacterized tissue 21 / 207932 75 / 479819 4 / 21833 7 / 51729 21 / 207932 75 / 479819 4 / 21833 7 / 51729
uterus   27 / 133582 519 / 10193077 -- 0 / 38063 27 / 133582 519 / 10193077 --
vascular 12 / 46250 -- 2091 / 13135050 -- 12 / 46250 -- 2091 / 13135050 --
white blood cells -- -- 39 / 846268 -- -- -- 39 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --