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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.249718Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 391 / 3316537 308 / 2498449 3233 / 114162531 3869 / 109592465 391 / 3316537 308 / 2498449 3233 / 114162531 3869 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077 4 / 57865 --   2 / 16077 4 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   40 / 29891 46 / 5047110 193 / 4978364 0 / 14774 40 / 29891 46 / 5047110 193 / 4978364
brain 86 / 506301 28 / 200215 20 / 729526 173 / 4997811 86 / 506301 28 / 200215 20 / 729526 173 / 4997811
cartilage 1 / 15965 5 / 37226 -- 21 / 778035 1 / 15965 5 / 37226 -- 21 / 778035
cerebellum 2 / 90353   2 / 90885 39 / 1495938 2 / 90353 0 / 0 2 / 90885 39 / 1495938
cerebrum 28 / 198932   -- -- 28 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 4 / 3888 6 / 44577 -- -- 4 / 3888 6 / 44577 -- --
colon 4 / 26551 13 / 151167 5 / 98089 14 / 643586 4 / 26551 13 / 151167 5 / 98089 14 / 643586
ear 2 / 16130 -- -- -- 2 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 25 / 246043   -- -- 25 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 3 / 19564   -- -- 3 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   3 / 17290 -- -- 0 / 270 3 / 17290 -- --
eye 7 / 128826 6 / 46440 1 / 85898 825 / 12434232 7 / 128826 6 / 46440 1 / 85898 825 / 12434232
gastrointestinal tract 2 / 28803 4 / 12721   -- 2 / 28803 4 / 12721 0 / 45908 --
heart 5 / 76442   2 / 83063 -- 5 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney 18 / 106627 11 / 89898 5 / 155372   18 / 106627 11 / 89898 5 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 8 / 96846 12 / 107249 3 / 66308 2 / 214987 8 / 96846 12 / 107249 3 / 66308 2 / 214987
lung 20 / 128150 6 / 170663 3 / 159917 4 / 159059 20 / 128150 6 / 170663 3 / 159917 4 / 159059
lymph node 9 / 62650 2 / 27007 141 / 5278419 207 / 4863489 9 / 62650 2 / 27007 141 / 5278419 207 / 4863489
lymphoreticular   1 / 44303 -- -- 0 / 17836 1 / 44303 -- --
mammary gland 4 / 46553 9 / 104307 1009 / 43166038 683 / 30312656 4 / 46553 9 / 104307 1009 / 43166038 683 / 30312656
muscle 9 / 74039 1 / 27691     9 / 74039 1 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 2 / 11462 4 / 89988 2 / 94887 4 / 179472 2 / 11462 4 / 89988 2 / 94887 4 / 179472
pancreas   1 / 74930 5 / 85728 2 / 189999 0 / 7237 1 / 74930 5 / 85728 2 / 189999
pancreatic islet 4 / 96524 5 / 30072 -- -- 4 / 96524 5 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland 2 / 13260   -- -- 2 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 12 / 241088 1 / 39531 4 / 207348 -- 12 / 241088 1 / 39531 4 / 207348 --
pooled tissue 27 / 276455   -- -- 27 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 4 / 79993 14 / 107080 8 / 266949 26 / 491794 4 / 79993 14 / 107080 8 / 266949 26 / 491794
retina 1 / 29438 -- 16 / 820326 4 / 88490 1 / 29438 -- 16 / 820326 4 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 5 / 73633 2 / 125377 624 / 26905847 838 / 34522313 5 / 73633 2 / 125377 624 / 26905847 838 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 5 / 52939   -- -- 5 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 457 / 6230144 -- -- -- 457 / 6230144 --
stomach 4 / 26641 5 / 65644 8 / 124767 16 / 448716 4 / 26641 5 / 65644 8 / 124767 16 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 30 / 143630 27 / 100058 -- 806 / 12372003 30 / 143630 27 / 100058 -- 806 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   2 / 32606 5 / 115938 10 / 124664 0 / 11737 2 / 32606 5 / 115938 10 / 124664
uncharacterized tissue 31 / 207932 76 / 479819   2 / 51729 31 / 207932 76 / 479819 0 / 21833 2 / 51729
uterus 8 / 38063 18 / 133582 170 / 10193077 -- 8 / 38063 18 / 133582 170 / 10193077 --
vascular 14 / 46250 -- 686 / 13135050 -- 14 / 46250 -- 686 / 13135050 --
white blood cells -- -- 11 / 846268 -- -- -- 11 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --