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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.248267Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 129 / 3316537 227 / 2498449 2426 / 114162531 1318 / 109592465 129 / 3316537 227 / 2498449 2426 / 114162531 1318 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077 2 / 57865 -- 4 / 83577 1 / 16077 2 / 57865 -- 4 / 83577
bone marrow   3 / 29891 18 / 5047110 78 / 4978364 0 / 14774 3 / 29891 18 / 5047110 78 / 4978364
brain 10 / 506301 13 / 200215 29 / 729526 239 / 4997811 10 / 506301 13 / 200215 29 / 729526 239 / 4997811
cartilage   1 / 37226 -- 46 / 778035 0 / 15965 1 / 37226 -- 46 / 778035
cerebellum       40 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 40 / 1495938
cerebrum 1 / 198932   -- -- 1 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   5 / 44577 -- -- 0 / 3888 5 / 44577 -- --
colon   23 / 151167 29 / 98089 78 / 643586 0 / 26551 23 / 151167 29 / 98089 78 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 23 / 246043   -- -- 23 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564   -- -- 1 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 17 / 128826 9 / 46440 8 / 85898 103 / 12434232 17 / 128826 9 / 46440 8 / 85898 103 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803 1 / 12721   -- 1 / 28803 1 / 12721 0 / 45908 --
heart     3 / 83063 -- 0 / 76442 0 / 1 3 / 83063 --
kidney 6 / 106627 3 / 89898 6 / 155372 7 / 100281 6 / 106627 3 / 89898 6 / 155372 7 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 7 / 96846 10 / 107249 9 / 66308 6 / 214987 7 / 96846 10 / 107249 9 / 66308 6 / 214987
lung 7 / 128150 11 / 170663 17 / 159917 23 / 159059 7 / 128150 11 / 170663 17 / 159917 23 / 159059
lymph node 1 / 62650   22 / 5278419 5 / 4863489 1 / 62650 0 / 27007 22 / 5278419 5 / 4863489
lymphoreticular   8 / 44303 -- -- 0 / 17836 8 / 44303 -- --
mammary gland 4 / 46553 6 / 104307 1246 / 43166038 377 / 30312656 4 / 46553 6 / 104307 1246 / 43166038 377 / 30312656
muscle 1 / 74039 6 / 27691 5 / 107836   1 / 74039 6 / 27691 5 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   2 / 89988 7 / 94887 8 / 179472 0 / 11462 2 / 89988 7 / 94887 8 / 179472
pancreas   8 / 74930 18 / 85728 18 / 189999 0 / 7237 8 / 74930 18 / 85728 18 / 189999
pancreatic islet 4 / 96524   -- -- 4 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 2 / 6170 -- -- -- 2 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 3 / 241088 2 / 39531 3 / 207348 -- 3 / 241088 2 / 39531 3 / 207348 --
pooled tissue 15 / 276455   -- -- 15 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 3 / 79993 1 / 107080 10 / 266949 25 / 491794 3 / 79993 1 / 107080 10 / 266949 25 / 491794
retina   -- 5 / 820326   0 / 29438 -- 5 / 820326 0 / 88490
salivary gland   7 / 10368 -- -- 0 / 2490 7 / 10368 -- --
skin 3 / 73633 8 / 125377 256 / 26905847 76 / 34522313 3 / 73633 8 / 125377 256 / 26905847 76 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 2 / 52939   -- -- 2 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 229 / 6230144 -- -- -- 229 / 6230144 --
stomach 2 / 26641 5 / 65644 2 / 124767 26 / 448716 2 / 26641 5 / 65644 2 / 124767 26 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 4 / 143630 3 / 100058 -- 155 / 12372003 4 / 143630 3 / 100058 -- 155 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     1 / 115938 1 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 1 / 115938 1 / 124664
uncharacterized tissue 3 / 207932 88 / 479819 6 / 21833 3 / 51729 3 / 207932 88 / 479819 6 / 21833 3 / 51729
uterus 4 / 38063 1 / 133582 283 / 10193077 -- 4 / 38063 1 / 133582 283 / 10193077 --
vascular 3 / 46250 -- 189 / 13135050 -- 3 / 46250 -- 189 / 13135050 --
white blood cells -- -- 25 / 846268 -- -- -- 25 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --