Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.247077Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 1251 / 3316537 1217 / 2498449 42944 / 114162531 35900 / 109592465 1251 / 3316537 1217 / 2498449 42944 / 114162531 35900 / 109592465
adrenal cortex -- 3 / 9928 -- -- -- 3 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 6 / 16077 47 / 57865 -- 2 / 83577 6 / 16077 47 / 57865 -- 2 / 83577
bone marrow 11 / 14774 24 / 29891 356 / 5047110 759 / 4978364 11 / 14774 24 / 29891 356 / 5047110 759 / 4978364
brain 141 / 506301 81 / 200215 212 / 729526 2040 / 4997811 141 / 506301 81 / 200215 212 / 729526 2040 / 4997811
cartilage 5 / 15965 19 / 37226 -- 181 / 778035 5 / 15965 19 / 37226 -- 181 / 778035
cerebellum 24 / 90353   7 / 90885 370 / 1495938 24 / 90353 0 / 0 7 / 90885 370 / 1495938
cerebrum 28 / 198932   -- -- 28 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 5 / 3888 49 / 44577 -- -- 5 / 3888 49 / 44577 -- --
colon 20 / 26551 67 / 151167 32 / 98089 452 / 643586 20 / 26551 67 / 151167 32 / 98089 452 / 643586
ear 3 / 16130 -- -- -- 3 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 119 / 246043   -- -- 119 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 8 / 19564 2 / 2857 -- -- 8 / 19564 2 / 2857 -- --
esophagus   10 / 17290 -- -- 0 / 270 10 / 17290 -- --
eye 30 / 128826 50 / 46440 21 / 85898 3413 / 12434232 30 / 128826 50 / 46440 21 / 85898 3413 / 12434232
gastrointestinal tract 15 / 28803 8 / 12721 6 / 45908 -- 15 / 28803 8 / 12721 6 / 45908 --
heart 28 / 76442   29 / 83063 -- 28 / 76442 0 / 1 29 / 83063 --
kidney 32 / 106627 40 / 89898 73 / 155372 73 / 100281 32 / 106627 40 / 89898 73 / 155372 73 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 15 / 96846 44 / 107249 8 / 66308 67 / 214987 15 / 96846 44 / 107249 8 / 66308 67 / 214987
lung 126 / 128150 67 / 170663 86 / 159917 35 / 159059 126 / 128150 67 / 170663 86 / 159917 35 / 159059
lymph node 24 / 62650 16 / 27007 1619 / 5278419 523 / 4863489 24 / 62650 16 / 27007 1619 / 5278419 523 / 4863489
lymphoreticular 5 / 17836 24 / 44303 -- -- 5 / 17836 24 / 44303 -- --
mammary gland 21 / 46553 23 / 104307 17370 / 43166038 10913 / 30312656 21 / 46553 23 / 104307 17370 / 43166038 10913 / 30312656
muscle 23 / 74039 8 / 27691 18 / 107836 23 / 61270 23 / 74039 8 / 27691 18 / 107836 23 / 61270
nervous 18 / 10333   -- -- 18 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 9 / 11462 40 / 89988 35 / 94887 55 / 179472 9 / 11462 40 / 89988 35 / 94887 55 / 179472
pancreas 4 / 7237 25 / 74930 21 / 85728 54 / 189999 4 / 7237 25 / 74930 21 / 85728 54 / 189999
pancreatic islet 22 / 96524 6 / 30072 -- -- 22 / 96524 6 / 30072 -- --
parathyroid   4 / 20557 -- -- 0 / 24 4 / 20557 -- --
peripheral nervous system 14 / 14891   -- -- 14 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 4 / 6170 -- -- -- 4 / 6170 -- -- --
pituitary gland 8 / 13260   -- -- 8 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 81 / 241088 32 / 39531 42 / 207348 -- 81 / 241088 32 / 39531 42 / 207348 --
pooled tissue 90 / 276455   -- -- 90 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 27 / 79993 64 / 107080 76 / 266949 100 / 491794 27 / 79993 64 / 107080 76 / 266949 100 / 491794
retina 10 / 29438 -- 99 / 820326 45 / 88490 10 / 29438 -- 99 / 820326 45 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 119 / 73633 64 / 125377 9484 / 26905847 13741 / 34522313 119 / 73633 64 / 125377 9484 / 26905847 13741 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 9 / 52939   -- -- 9 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 1444 / 6230144 -- -- -- 1444 / 6230144 --
stomach 11 / 26641 31 / 65644 19 / 124767 83 / 448716 11 / 26641 31 / 65644 19 / 124767 83 / 448716
synovium   1 / 1650 -- -- 0 / 249 1 / 1650 -- --
testis 42 / 143630 38 / 100058 -- 2897 / 12372003 42 / 143630 38 / 100058 -- 2897 / 12372003
thymus 2 / 4478 1 / 165 -- -- 2 / 4478 1 / 165 -- --
thyroid 7 / 11737 10 / 32606 37 / 115938 57 / 124664 7 / 11737 10 / 32606 37 / 115938 57 / 124664
uncharacterized tissue 63 / 207932 222 / 479819 14 / 21833 17 / 51729 63 / 207932 222 / 479819 14 / 21833 17 / 51729
uterus 3 / 38063 97 / 133582 4041 / 10193077 -- 3 / 38063 97 / 133582 4041 / 10193077 --
vascular 16 / 46250 -- 7373 / 13135050 -- 16 / 46250 -- 7373 / 13135050 --
white blood cells -- -- 422 / 846268 -- -- -- 422 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --