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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.246112Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 556 / 3316537 662 / 2498449 6588 / 114162531 9109 / 109592465 556 / 3316537 662 / 2498449 6588 / 114162531 9109 / 109592465
adrenal cortex -- 2 / 9928 -- -- -- 2 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077 19 / 57865 --   2 / 16077 19 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 1 / 14774   187 / 5047110 60 / 4978364 1 / 14774 0 / 29891 187 / 5047110 60 / 4978364
brain 67 / 506301 37 / 200215 55 / 729526 906 / 4997811 67 / 506301 37 / 200215 55 / 729526 906 / 4997811
cartilage 3 / 15965 6 / 37226 -- 51 / 778035 3 / 15965 6 / 37226 -- 51 / 778035
cerebellum 29 / 90353   14 / 90885 373 / 1495938 29 / 90353 0 / 0 14 / 90885 373 / 1495938
cerebrum 27 / 198932   -- -- 27 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   6 / 44577 -- -- 0 / 3888 6 / 44577 -- --
colon 3 / 26551 58 / 151167 2 / 98089 64 / 643586 3 / 26551 58 / 151167 2 / 98089 64 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 84 / 246043   -- -- 84 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   7 / 17290 -- -- 0 / 270 7 / 17290 -- --
eye 22 / 128826 11 / 46440 15 / 85898 1279 / 12434232 22 / 128826 11 / 46440 15 / 85898 1279 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803 1 / 12721 1 / 45908 -- 1 / 28803 1 / 12721 1 / 45908 --
heart 16 / 76442   5 / 83063 -- 16 / 76442 0 / 1 5 / 83063 --
kidney 6 / 106627 22 / 89898 26 / 155372 16 / 100281 6 / 106627 22 / 89898 26 / 155372 16 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 4 / 96846 20 / 107249 4 / 66308 25 / 214987 4 / 96846 20 / 107249 4 / 66308 25 / 214987
lung 22 / 128150 50 / 170663 9 / 159917 22 / 159059 22 / 128150 50 / 170663 9 / 159917 22 / 159059
lymph node 44 / 62650 3 / 27007 643 / 5278419 154 / 4863489 44 / 62650 3 / 27007 643 / 5278419 154 / 4863489
lymphoreticular 7 / 17836 17 / 44303 -- -- 7 / 17836 17 / 44303 -- --
mammary gland 5 / 46553 29 / 104307 983 / 43166038 2270 / 30312656 5 / 46553 29 / 104307 983 / 43166038 2270 / 30312656
muscle 3 / 74039 8 / 27691 4 / 107836 14 / 61270 3 / 74039 8 / 27691 4 / 107836 14 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 23 / 89988 11 / 94887 36 / 179472 1 / 11462 23 / 89988 11 / 94887 36 / 179472
pancreas   12 / 74930 6 / 85728 25 / 189999 0 / 7237 12 / 74930 6 / 85728 25 / 189999
pancreatic islet 15 / 96524 2 / 30072 -- -- 15 / 96524 2 / 30072 -- --
parathyroid   2 / 20557 -- -- 0 / 24 2 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 2 / 6170 -- -- -- 2 / 6170 -- -- --
pituitary gland 3 / 13260   -- -- 3 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 55 / 241088 32 / 39531 43 / 207348 -- 55 / 241088 32 / 39531 43 / 207348 --
pooled tissue 30 / 276455   -- -- 30 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 13 / 79993 11 / 107080 16 / 266949 43 / 491794 13 / 79993 11 / 107080 16 / 266949 43 / 491794
retina 6 / 29438 -- 183 / 820326 49 / 88490 6 / 29438 -- 183 / 820326 49 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 9 / 73633 48 / 125377 1340 / 26905847 1500 / 34522313 9 / 73633 48 / 125377 1340 / 26905847 1500 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 7 / 52939   -- -- 7 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 705 / 6230144 -- -- -- 705 / 6230144 --
stomach 5 / 26641 12 / 65644 17 / 124767 102 / 448716 5 / 26641 12 / 65644 17 / 124767 102 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 18 / 143630 40 / 100058 -- 2092 / 12372003 18 / 143630 40 / 100058 -- 2092 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 3 / 11737 5 / 32606 14 / 115938 4 / 124664 3 / 11737 5 / 32606 14 / 115938 4 / 124664
uncharacterized tissue 35 / 207932 136 / 479819 1 / 21833 24 / 51729 35 / 207932 136 / 479819 1 / 21833 24 / 51729
uterus 2 / 38063 43 / 133582 1459 / 10193077 -- 2 / 38063 43 / 133582 1459 / 10193077 --
vascular   -- 761 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 761 / 13135050 --
white blood cells -- -- 84 / 846268 -- -- -- 84 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --