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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.239666Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 101 / 3316537 59 / 2498449 1262 / 114162531 4069 / 109592465 101 / 3316537 59 / 2498449 1262 / 114162531 4069 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   5 / 57865 --   0 / 16077 5 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   3 / 29891 2 / 5047110 11 / 4978364 0 / 14774 3 / 29891 2 / 5047110 11 / 4978364
brain 21 / 506301 2 / 200215 3 / 729526 46 / 4997811 21 / 506301 2 / 200215 3 / 729526 46 / 4997811
cartilage   1 / 37226 -- 6 / 778035 0 / 15965 1 / 37226 -- 6 / 778035
cerebellum 1 / 90353   1 / 90885 2 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 1 / 90885 2 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon   6 / 151167   1 / 643586 0 / 26551 6 / 151167 0 / 98089 1 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 7 / 246043   -- -- 7 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 5 / 128826     2618 / 12434232 5 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 2618 / 12434232
gastrointestinal tract   1 / 12721   -- 0 / 28803 1 / 12721 0 / 45908 --
heart     1 / 83063 -- 0 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 14 / 106627 5 / 89898     14 / 106627 5 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 4 / 96846 5 / 107249   5 / 214987 4 / 96846 5 / 107249 0 / 66308 5 / 214987
lung 2 / 128150 1 / 170663 1 / 159917 3 / 159059 2 / 128150 1 / 170663 1 / 159917 3 / 159059
lymph node 1 / 62650 1 / 27007 163 / 5278419 36 / 4863489 1 / 62650 1 / 27007 163 / 5278419 36 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 3 / 46553 1 / 104307 11 / 43166038 428 / 30312656 3 / 46553 1 / 104307 11 / 43166038 428 / 30312656
muscle 3 / 74039   1 / 107836   3 / 74039 0 / 27691 1 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 1 / 89988 1 / 94887 1 / 179472 1 / 11462 1 / 89988 1 / 94887 1 / 179472
pancreas   2 / 74930   2 / 189999 0 / 7237 2 / 74930 0 / 85728 2 / 189999
pancreatic islet 5 / 96524 1 / 30072 -- -- 5 / 96524 1 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 16 / 241088   3 / 207348 -- 16 / 241088 0 / 39531 3 / 207348 --
pooled tissue 14 / 276455   -- -- 14 / 276455 0 / 0 -- --
prostate     1 / 266949 3 / 491794 0 / 79993 0 / 107080 1 / 266949 3 / 491794
retina   -- 9 / 820326 2 / 88490 0 / 29438 -- 9 / 820326 2 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin   1 / 125377 335 / 26905847 588 / 34522313 0 / 73633 1 / 125377 335 / 26905847 588 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 330 / 6230144 -- -- -- 330 / 6230144 --
stomach   3 / 65644 1 / 124767 12 / 448716 0 / 26641 3 / 65644 1 / 124767 12 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis   1 / 100058 -- 304 / 12372003 0 / 143630 1 / 100058 -- 304 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     1 / 115938   0 / 11737 0 / 32606 1 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 1 / 207932 15 / 479819   1 / 51729 1 / 207932 15 / 479819 0 / 21833 1 / 51729
uterus 1 / 38063 4 / 133582 31 / 10193077 -- 1 / 38063 4 / 133582 31 / 10193077 --
vascular   -- 363 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 363 / 13135050 --
white blood cells -- -- 4 / 846268 -- -- -- 4 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --