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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.239Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 52 / 3316537 229 / 2498449 957 / 114162531 5724 / 109592465 52 / 3316537 229 / 2498449 957 / 114162531 5724 / 109592465
adrenal cortex -- 2 / 9928 -- -- -- 2 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   3 / 57865 --   0 / 16077 3 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     19 / 5047110   0 / 14774 0 / 29891 19 / 5047110 0 / 4978364
brain 1 / 506301 11 / 200215   105 / 4997811 1 / 506301 11 / 200215 0 / 729526 105 / 4997811
cartilage   1 / 37226 -- 4 / 778035 0 / 15965 1 / 37226 -- 4 / 778035
cerebellum       51 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 51 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   5 / 44577 -- -- 0 / 3888 5 / 44577 -- --
colon   17 / 151167   48 / 643586 0 / 26551 17 / 151167 0 / 98089 48 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 25 / 246043   -- -- 25 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   2 / 17290 -- -- 0 / 270 2 / 17290 -- --
eye   8 / 46440   801 / 12434232 0 / 128826 8 / 46440 0 / 85898 801 / 12434232
gastrointestinal tract   1 / 12721 1 / 45908 -- 0 / 28803 1 / 12721 1 / 45908 --
heart 2 / 76442     -- 2 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney   7 / 89898 4 / 155372 2 / 100281 0 / 106627 7 / 89898 4 / 155372 2 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 2 / 96846 3 / 107249   1 / 214987 2 / 96846 3 / 107249 0 / 66308 1 / 214987
lung 1 / 128150 12 / 170663   2 / 159059 1 / 128150 12 / 170663 0 / 159917 2 / 159059
lymph node 3 / 62650   72 / 5278419 29 / 4863489 3 / 62650 0 / 27007 72 / 5278419 29 / 4863489
lymphoreticular   27 / 44303 -- -- 0 / 17836 27 / 44303 -- --
mammary gland   9 / 104307 104 / 43166038 494 / 30312656 0 / 46553 9 / 104307 104 / 43166038 494 / 30312656
muscle   7 / 27691     0 / 74039 7 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   13 / 89988 2 / 94887 8 / 179472 0 / 11462 13 / 89988 2 / 94887 8 / 179472
pancreas   4 / 74930 1 / 85728 2 / 189999 0 / 7237 4 / 74930 1 / 85728 2 / 189999
pancreatic islet     -- -- 0 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 2 / 241088 16 / 39531   -- 2 / 241088 16 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 8 / 276455   -- -- 8 / 276455 0 / 0 -- --
prostate   9 / 107080 2 / 266949 12 / 491794 0 / 79993 9 / 107080 2 / 266949 12 / 491794
retina   -- 1 / 820326 12 / 88490 0 / 29438 -- 1 / 820326 12 / 88490
salivary gland   3 / 10368 -- -- 0 / 2490 3 / 10368 -- --
skin   18 / 125377 59 / 26905847 2001 / 34522313 0 / 73633 18 / 125377 59 / 26905847 2001 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 209 / 6230144 -- -- -- 209 / 6230144 --
stomach   2 / 65644 1 / 124767 14 / 448716 0 / 26641 2 / 65644 1 / 124767 14 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 3 / 143630 4 / 100058 -- 2137 / 12372003 3 / 143630 4 / 100058 -- 2137 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid         0 / 11737 0 / 32606 0 / 115938 0 / 124664
uncharacterized tissue 1 / 207932 22 / 479819   1 / 51729 1 / 207932 22 / 479819 0 / 21833 1 / 51729
uterus   23 / 133582 2 / 10193077 -- 0 / 38063 23 / 133582 2 / 10193077 --
vascular 2 / 46250 -- 478 / 13135050 -- 2 / 46250 -- 478 / 13135050 --
white blood cells -- -- 2 / 846268 -- -- -- 2 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --