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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.23388Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 95 / 3316537 68 / 2498449 4869 / 114162531 1194 / 109592465 95 / 3316537 68 / 2498449 4869 / 114162531 1194 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077   --   1 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow         0 / 14774 0 / 29891 0 / 5047110 0 / 4978364
brain 16 / 506301 4 / 200215 31 / 729526 151 / 4997811 16 / 506301 4 / 200215 31 / 729526 151 / 4997811
cartilage   1 / 37226 -- 7 / 778035 0 / 15965 1 / 37226 -- 7 / 778035
cerebellum 1 / 90353   1 / 90885 27 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 1 / 90885 27 / 1495938
cerebrum 4 / 198932   -- -- 4 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon   9 / 151167   5 / 643586 0 / 26551 9 / 151167 0 / 98089 5 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 3 / 246043   -- -- 3 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564   -- -- 1 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 4 / 128826 1 / 46440   430 / 12434232 4 / 128826 1 / 46440 0 / 85898 430 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart     2 / 83063 -- 0 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney 2 / 106627 7 / 89898     2 / 106627 7 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 1 / 96846   1 / 66308   1 / 96846 0 / 107249 1 / 66308 0 / 214987
lung   15 / 170663 1 / 159917   0 / 128150 15 / 170663 1 / 159917 0 / 159059
lymph node   3 / 27007 24 / 5278419   0 / 62650 3 / 27007 24 / 5278419 0 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 1 / 46553 1 / 104307 4555 / 43166038 288 / 30312656 1 / 46553 1 / 104307 4555 / 43166038 288 / 30312656
muscle 4 / 74039       4 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary       1 / 179472 0 / 11462 0 / 89988 0 / 94887 1 / 179472
pancreas   2 / 74930 1 / 85728   0 / 7237 2 / 74930 1 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet 18 / 96524 2 / 30072 -- -- 18 / 96524 2 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 19 / 241088     -- 19 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 8 / 276455   -- -- 8 / 276455 0 / 0 -- --
prostate       4 / 491794 0 / 79993 0 / 107080 0 / 266949 4 / 491794
retina 2 / 29438 -- 4 / 820326   2 / 29438 -- 4 / 820326 0 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 2 / 73633 6 / 125377 53 / 26905847 268 / 34522313 2 / 73633 6 / 125377 53 / 26905847 268 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 2 / 6230144 -- -- -- 2 / 6230144 --
stomach   5 / 65644   7 / 448716 0 / 26641 5 / 65644 0 / 124767 7 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 5 / 143630 3 / 100058 -- 3 / 12372003 5 / 143630 3 / 100058 -- 3 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     7 / 115938 3 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 7 / 115938 3 / 124664
uncharacterized tissue   3 / 479819     0 / 207932 3 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 1 / 38063 4 / 133582 130 / 10193077 -- 1 / 38063 4 / 133582 130 / 10193077 --
vascular   -- 56 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 56 / 13135050 --
white blood cells -- -- 1 / 846268 -- -- -- 1 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --