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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.229335Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 115 / 3316537 65 / 2498449 3626 / 114162531 4495 / 109592465 115 / 3316537 65 / 2498449 3626 / 114162531 4495 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     15 / 5047110 2 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 15 / 5047110 2 / 4978364
brain 20 / 506301 3 / 200215 5 / 729526 60 / 4997811 20 / 506301 3 / 200215 5 / 729526 60 / 4997811
cartilage 1 / 15965 1 / 37226 -- 2 / 778035 1 / 15965 1 / 37226 -- 2 / 778035
cerebellum     2 / 90885 30 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 2 / 90885 30 / 1495938
cerebrum 7 / 198932   -- -- 7 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon   4 / 151167 1 / 98089   0 / 26551 4 / 151167 1 / 98089 0 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 5 / 246043   -- -- 5 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 3 / 128826 3 / 46440   284 / 12434232 3 / 128826 3 / 46440 0 / 85898 284 / 12434232
gastrointestinal tract 4 / 28803   1 / 45908 -- 4 / 28803 0 / 12721 1 / 45908 --
heart     1 / 83063 -- 0 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 5 / 106627 2 / 89898 2 / 155372 1 / 100281 5 / 106627 2 / 89898 2 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver   1 / 107249 1 / 66308 2 / 214987 0 / 96846 1 / 107249 1 / 66308 2 / 214987
lung   2 / 170663 3 / 159917 2 / 159059 0 / 128150 2 / 170663 3 / 159917 2 / 159059
lymph node     214 / 5278419 52 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 214 / 5278419 52 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland     28 / 43166038 849 / 30312656 0 / 46553 0 / 104307 28 / 43166038 849 / 30312656
muscle 4 / 74039       4 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary     3 / 94887 1 / 179472 0 / 11462 0 / 89988 3 / 94887 1 / 179472
pancreas   2 / 74930     0 / 7237 2 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet 4 / 96524   -- -- 4 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   3 / 20557 -- -- 0 / 24 3 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 1 / 241088   19 / 207348 -- 1 / 241088 0 / 39531 19 / 207348 --
pooled tissue 8 / 276455   -- -- 8 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 2 / 79993   3 / 266949 2 / 491794 2 / 79993 0 / 107080 3 / 266949 2 / 491794
retina   -- 17 / 820326 1 / 88490 0 / 29438 -- 17 / 820326 1 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 35 / 73633 1 / 125377 2711 / 26905847 3093 / 34522313 35 / 73633 1 / 125377 2711 / 26905847 3093 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 162 / 6230144 -- -- -- 162 / 6230144 --
stomach   6 / 65644   2 / 448716 0 / 26641 6 / 65644 0 / 124767 2 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 3 / 143630 9 / 100058 -- 108 / 12372003 3 / 143630 9 / 100058 -- 108 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   1 / 32606 3 / 115938 2 / 124664 0 / 11737 1 / 32606 3 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue 6 / 207932 23 / 479819   2 / 51729 6 / 207932 23 / 479819 0 / 21833 2 / 51729
uterus 5 / 38063 3 / 133582 208 / 10193077 -- 5 / 38063 3 / 133582 208 / 10193077 --
vascular   -- 221 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 221 / 13135050 --
white blood cells -- -- 6 / 846268 -- -- -- 6 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --