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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.223141Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 312 / 3316537 457 / 2498449 4567 / 114162531 3117 / 109592465 312 / 3316537 457 / 2498449 4567 / 114162531 3117 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 3 / 16077 16 / 57865 --   3 / 16077 16 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 4 / 14774 8 / 29891 43 / 5047110 39 / 4978364 4 / 14774 8 / 29891 43 / 5047110 39 / 4978364
brain 22 / 506301 25 / 200215 11 / 729526 100 / 4997811 22 / 506301 25 / 200215 11 / 729526 100 / 4997811
cartilage 2 / 15965 6 / 37226 -- 26 / 778035 2 / 15965 6 / 37226 -- 26 / 778035
cerebellum       29 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 29 / 1495938
cerebrum 2 / 198932   -- -- 2 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   5 / 44577 -- -- 0 / 3888 5 / 44577 -- --
colon   42 / 151167 1 / 98089 37 / 643586 0 / 26551 42 / 151167 1 / 98089 37 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 48 / 246043   -- -- 48 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 2 / 19564   -- -- 2 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   2 / 17290 -- -- 0 / 270 2 / 17290 -- --
eye 16 / 128826 8 / 46440 3 / 85898 396 / 12434232 16 / 128826 8 / 46440 3 / 85898 396 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803 6 / 12721 2 / 45908 -- 1 / 28803 6 / 12721 2 / 45908 --
heart 12 / 76442   1 / 83063 -- 12 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 9 / 106627 21 / 89898 28 / 155372   9 / 106627 21 / 89898 28 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 15 / 96846 50 / 107249 1 / 66308 4 / 214987 15 / 96846 50 / 107249 1 / 66308 4 / 214987
lung 14 / 128150 13 / 170663 6 / 159917 2 / 159059 14 / 128150 13 / 170663 6 / 159917 2 / 159059
lymph node 14 / 62650   32 / 5278419 18 / 4863489 14 / 62650 0 / 27007 32 / 5278419 18 / 4863489
lymphoreticular 5 / 17836 19 / 44303 -- -- 5 / 17836 19 / 44303 -- --
mammary gland 4 / 46553 21 / 104307 2923 / 43166038 876 / 30312656 4 / 46553 21 / 104307 2923 / 43166038 876 / 30312656
muscle 7 / 74039 9 / 27691 1 / 107836 1 / 61270 7 / 74039 9 / 27691 1 / 107836 1 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 13 / 89988 7 / 94887 12 / 179472 1 / 11462 13 / 89988 7 / 94887 12 / 179472
pancreas   10 / 74930 17 / 85728 9 / 189999 0 / 7237 10 / 74930 17 / 85728 9 / 189999
pancreatic islet 12 / 96524 3 / 30072 -- -- 12 / 96524 3 / 30072 -- --
parathyroid   3 / 20557 -- -- 0 / 24 3 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 3 / 13260   -- -- 3 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 16 / 241088 12 / 39531 5 / 207348 -- 16 / 241088 12 / 39531 5 / 207348 --
pooled tissue 27 / 276455   -- -- 27 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 5 / 79993 27 / 107080 8 / 266949 33 / 491794 5 / 79993 27 / 107080 8 / 266949 33 / 491794
retina   -- 3 / 820326 2 / 88490 0 / 29438 -- 3 / 820326 2 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 8 / 73633 36 / 125377 594 / 26905847 1224 / 34522313 8 / 73633 36 / 125377 594 / 26905847 1224 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 425 / 6230144 -- -- -- 425 / 6230144 --
stomach 4 / 26641 15 / 65644 4 / 124767 26 / 448716 4 / 26641 15 / 65644 4 / 124767 26 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 11 / 143630 15 / 100058 -- 279 / 12372003 11 / 143630 15 / 100058 -- 279 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737 2 / 32606 3 / 115938 2 / 124664 1 / 11737 2 / 32606 3 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue 21 / 207932 49 / 479819   2 / 51729 21 / 207932 49 / 479819 0 / 21833 2 / 51729
uterus 11 / 38063 21 / 133582 36 / 10193077 -- 11 / 38063 21 / 133582 36 / 10193077 --
vascular 8 / 46250 -- 363 / 13135050 -- 8 / 46250 -- 363 / 13135050 --
white blood cells -- -- 50 / 846268 -- -- -- 50 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --