Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.220950Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 259 / 3316537 169 / 2498449 6573 / 114162531 6737 / 109592465 259 / 3316537 169 / 2498449 6573 / 114162531 6737 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077 3 / 57865 --   1 / 16077 3 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow     35 / 5047110 7 / 4978364 0 / 14774 0 / 29891 35 / 5047110 7 / 4978364
brain 39 / 506301 32 / 200215 55 / 729526 433 / 4997811 39 / 506301 32 / 200215 55 / 729526 433 / 4997811
cartilage 2 / 15965 2 / 37226 -- 11 / 778035 2 / 15965 2 / 37226 -- 11 / 778035
cerebellum 8 / 90353   10 / 90885 103 / 1495938 8 / 90353 0 / 0 10 / 90885 103 / 1495938
cerebrum 7 / 198932   -- -- 7 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   6 / 44577 -- -- 0 / 3888 6 / 44577 -- --
colon   10 / 151167 1 / 98089 5 / 643586 0 / 26551 10 / 151167 1 / 98089 5 / 643586
ear 5 / 16130 -- -- -- 5 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 15 / 246043   -- -- 15 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 3 / 19564   -- -- 3 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 19 / 128826 9 / 46440 2 / 85898 808 / 12434232 19 / 128826 9 / 46440 2 / 85898 808 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803   3 / 45908 -- 1 / 28803 0 / 12721 3 / 45908 --
heart 1 / 76442   6 / 83063 -- 1 / 76442 0 / 1 6 / 83063 --
kidney 5 / 106627 11 / 89898 9 / 155372 1 / 100281 5 / 106627 11 / 89898 9 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 7 / 96846 3 / 107249 5 / 66308 9 / 214987 7 / 96846 3 / 107249 5 / 66308 9 / 214987
lung 8 / 128150 9 / 170663 7 / 159917 14 / 159059 8 / 128150 9 / 170663 7 / 159917 14 / 159059
lymph node 7 / 62650   377 / 5278419 13 / 4863489 7 / 62650 0 / 27007 377 / 5278419 13 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland   9 / 104307 1026 / 43166038 1889 / 30312656 0 / 46553 9 / 104307 1026 / 43166038 1889 / 30312656
muscle 9 / 74039 7 / 27691 4 / 107836 6 / 61270 9 / 74039 7 / 27691 4 / 107836 6 / 61270
nervous 1 / 10333   -- -- 1 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 3 / 11462 13 / 89988 3 / 94887 11 / 179472 3 / 11462 13 / 89988 3 / 94887 11 / 179472
pancreas   2 / 74930 4 / 85728 3 / 189999 0 / 7237 2 / 74930 4 / 85728 3 / 189999
pancreatic islet 4 / 96524   -- -- 4 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 14 / 241088   4 / 207348 -- 14 / 241088 0 / 39531 4 / 207348 --
pooled tissue 24 / 276455   -- -- 24 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 8 / 79993 6 / 107080 8 / 266949 11 / 491794 8 / 79993 6 / 107080 8 / 266949 11 / 491794
retina 22 / 29438 -- 77 / 820326 26 / 88490 22 / 29438 -- 77 / 820326 26 / 88490
salivary gland   3 / 10368 -- -- 0 / 2490 3 / 10368 -- --
skin 11 / 73633 4 / 125377 3029 / 26905847 3127 / 34522313 11 / 73633 4 / 125377 3029 / 26905847 3127 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 3 / 52939   -- -- 3 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 165 / 6230144 -- -- -- 165 / 6230144 --
stomach 1 / 26641 2 / 65644 7 / 124767 29 / 448716 1 / 26641 2 / 65644 7 / 124767 29 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 6 / 143630 2 / 100058 -- 224 / 12372003 6 / 143630 2 / 100058 -- 224 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 2 / 11737 2 / 32606 7 / 115938 5 / 124664 2 / 11737 2 / 32606 7 / 115938 5 / 124664
uncharacterized tissue 12 / 207932 23 / 479819   2 / 51729 12 / 207932 23 / 479819 0 / 21833 2 / 51729
uterus 2 / 38063 8 / 133582 1181 / 10193077 -- 2 / 38063 8 / 133582 1181 / 10193077 --
vascular 4 / 46250 -- 514 / 13135050 -- 4 / 46250 -- 514 / 13135050 --
white blood cells -- -- 34 / 846268 -- -- -- 34 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --