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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.212088Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 233 / 3316537 129 / 2498449 1163 / 114162531 766 / 109592465 233 / 3316537 129 / 2498449 1163 / 114162531 766 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077   -- 1 / 83577 2 / 16077 0 / 57865 -- 1 / 83577
bone marrow 1 / 14774 4 / 29891 15 / 5047110 24 / 4978364 1 / 14774 4 / 29891 15 / 5047110 24 / 4978364
brain 19 / 506301 8 / 200215 2 / 729526 37 / 4997811 19 / 506301 8 / 200215 2 / 729526 37 / 4997811
cartilage   1 / 37226 --   0 / 15965 1 / 37226 -- 0 / 778035
cerebellum 9 / 90353   1 / 90885 9 / 1495938 9 / 90353 0 / 0 1 / 90885 9 / 1495938
cerebrum 13 / 198932   -- -- 13 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon 3 / 26551 11 / 151167 1 / 98089 3 / 643586 3 / 26551 11 / 151167 1 / 98089 3 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 4 / 246043   -- -- 4 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 8 / 19564   -- -- 8 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 9 / 128826 3 / 46440   91 / 12434232 9 / 128826 3 / 46440 0 / 85898 91 / 12434232
gastrointestinal tract 13 / 28803   1 / 45908 -- 13 / 28803 0 / 12721 1 / 45908 --
heart 9 / 76442   2 / 83063 -- 9 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney 44 / 106627 8 / 89898 1 / 155372   44 / 106627 8 / 89898 1 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 13 / 96846 12 / 107249 6 / 66308   13 / 96846 12 / 107249 6 / 66308 0 / 214987
lung 6 / 128150 8 / 170663   2 / 159059 6 / 128150 8 / 170663 0 / 159917 2 / 159059
lymph node     3 / 5278419 2 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 3 / 5278419 2 / 4863489
lymphoreticular 4 / 17836   -- -- 4 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 6 / 46553 2 / 104307 237 / 43166038 281 / 30312656 6 / 46553 2 / 104307 237 / 43166038 281 / 30312656
muscle 1 / 74039       1 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   3 / 89988   2 / 179472 0 / 11462 3 / 89988 0 / 94887 2 / 179472
pancreas   1 / 74930     0 / 7237 1 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet 5 / 96524 2 / 30072 -- -- 5 / 96524 2 / 30072 -- --
parathyroid   2 / 20557 -- -- 0 / 24 2 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 9 / 241088   2 / 207348 -- 9 / 241088 0 / 39531 2 / 207348 --
pooled tissue 15 / 276455   -- -- 15 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 22 / 79993 13 / 107080 4 / 266949 16 / 491794 22 / 79993 13 / 107080 4 / 266949 16 / 491794
retina 2 / 29438 -- 11 / 820326 1 / 88490 2 / 29438 -- 11 / 820326 1 / 88490
salivary gland 1 / 2490   -- -- 1 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 1 / 73633   444 / 26905847 242 / 34522313 1 / 73633 0 / 125377 444 / 26905847 242 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 2 / 52939   -- -- 2 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 19 / 6230144 -- -- -- 19 / 6230144 --
stomach   5 / 65644 2 / 124767 4 / 448716 0 / 26641 5 / 65644 2 / 124767 4 / 448716
synovium   1 / 1650 -- -- 0 / 249 1 / 1650 -- --
testis 3 / 143630 9 / 100058 -- 49 / 12372003 3 / 143630 9 / 100058 -- 49 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 1 / 11737   3 / 115938 2 / 124664 1 / 11737 0 / 32606 3 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue 5 / 207932 33 / 479819     5 / 207932 33 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 3 / 38063 1 / 133582 399 / 10193077 -- 3 / 38063 1 / 133582 399 / 10193077 --
vascular   -- 9 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 9 / 13135050 --
white blood cells -- -- 1 / 846268 -- -- -- 1 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --