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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.201253Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 311 / 3316537 285 / 2498449 5255 / 114162531 8988 / 109592465 311 / 3316537 285 / 2498449 5255 / 114162531 8988 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077 8 / 57865 --   1 / 16077 8 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow   3 / 29891 9 / 5047110 11 / 4978364 0 / 14774 3 / 29891 9 / 5047110 11 / 4978364
brain 55 / 506301 16 / 200215 42 / 729526 221 / 4997811 55 / 506301 16 / 200215 42 / 729526 221 / 4997811
cartilage 1 / 15965 8 / 37226 -- 12 / 778035 1 / 15965 8 / 37226 -- 12 / 778035
cerebellum 8 / 90353   7 / 90885 63 / 1495938 8 / 90353 0 / 0 7 / 90885 63 / 1495938
cerebrum 28 / 198932 3 / 3422 -- -- 28 / 198932 3 / 3422 -- --
cervix   4 / 44577 -- -- 0 / 3888 4 / 44577 -- --
colon   28 / 151167 1 / 98089 14 / 643586 0 / 26551 28 / 151167 1 / 98089 14 / 643586
ear 9 / 16130 -- -- -- 9 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 49 / 246043   -- -- 49 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 1 / 19564 1 / 2857 -- -- 1 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 4 / 128826 7 / 46440 1 / 85898 3115 / 12434232 4 / 128826 7 / 46440 1 / 85898 3115 / 12434232
gastrointestinal tract   5 / 12721 2 / 45908 -- 0 / 28803 5 / 12721 2 / 45908 --
heart 17 / 76442   1 / 83063 -- 17 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 14 / 106627 6 / 89898 8 / 155372 1 / 100281 14 / 106627 6 / 89898 8 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 8 / 96846 11 / 107249   2 / 214987 8 / 96846 11 / 107249 0 / 66308 2 / 214987
lung 4 / 128150 14 / 170663   7 / 159059 4 / 128150 14 / 170663 0 / 159917 7 / 159059
lymph node 8 / 62650 1 / 27007 398 / 5278419 107 / 4863489 8 / 62650 1 / 27007 398 / 5278419 107 / 4863489
lymphoreticular 1 / 17836 2 / 44303 -- -- 1 / 17836 2 / 44303 -- --
mammary gland 11 / 46553 16 / 104307 35 / 43166038 2479 / 30312656 11 / 46553 16 / 104307 35 / 43166038 2479 / 30312656
muscle 4 / 74039 5 / 27691     4 / 74039 5 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 4 / 89988 2 / 94887 4 / 179472 1 / 11462 4 / 89988 2 / 94887 4 / 179472
pancreas   4 / 74930 3 / 85728   0 / 7237 4 / 74930 3 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet 2 / 96524   -- -- 2 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   3 / 20557 -- -- 0 / 24 3 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 6 / 241088 1 / 39531 6 / 207348 -- 6 / 241088 1 / 39531 6 / 207348 --
pooled tissue 16 / 276455   -- -- 16 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 10 / 79993 10 / 107080 5 / 266949 10 / 491794 10 / 79993 10 / 107080 5 / 266949 10 / 491794
retina 8 / 29438 -- 45 / 820326 13 / 88490 8 / 29438 -- 45 / 820326 13 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 1 / 73633 14 / 125377 1602 / 26905847 1484 / 34522313 1 / 73633 14 / 125377 1602 / 26905847 1484 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 3 / 52939   -- -- 3 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 648 / 6230144 -- -- -- 648 / 6230144 --
stomach 1 / 26641 5 / 65644 3 / 124767 8 / 448716 1 / 26641 5 / 65644 3 / 124767 8 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 21 / 143630 30 / 100058 -- 1434 / 12372003 21 / 143630 30 / 100058 -- 1434 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 3 / 11737 5 / 32606   1 / 124664 3 / 11737 5 / 32606 0 / 115938 1 / 124664
uncharacterized tissue 9 / 207932 45 / 479819   2 / 51729 9 / 207932 45 / 479819 0 / 21833 2 / 51729
uterus 2 / 38063 24 / 133582 511 / 10193077 -- 2 / 38063 24 / 133582 511 / 10193077 --
vascular 3 / 46250 -- 1913 / 13135050 -- 3 / 46250 -- 1913 / 13135050 --
white blood cells -- -- 13 / 846268 -- -- -- 13 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --