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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.200250Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 232 / 3316537 64 / 2498449 1033 / 114162531 1406 / 109592465 232 / 3316537 64 / 2498449 1033 / 114162531 1406 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 1 / 16077 2 / 57865 --   1 / 16077 2 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 2 / 14774 2 / 29891 67 / 5047110 13 / 4978364 2 / 14774 2 / 29891 67 / 5047110 13 / 4978364
brain 26 / 506301 11 / 200215 12 / 729526 59 / 4997811 26 / 506301 11 / 200215 12 / 729526 59 / 4997811
cartilage   1 / 37226 -- 1 / 778035 0 / 15965 1 / 37226 -- 1 / 778035
cerebellum       15 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 0 / 90885 15 / 1495938
cerebrum 6 / 198932   -- -- 6 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   1 / 44577 -- -- 0 / 3888 1 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 3 / 151167   5 / 643586 1 / 26551 3 / 151167 0 / 98089 5 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 11 / 246043   -- -- 11 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine 4 / 19564 1 / 2857 -- -- 4 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 5 / 128826     245 / 12434232 5 / 128826 0 / 46440 0 / 85898 245 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 5 / 76442   3 / 83063 -- 5 / 76442 0 / 1 3 / 83063 --
kidney 6 / 106627 3 / 89898 3 / 155372   6 / 106627 3 / 89898 3 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 5 / 96846 1 / 107249 1 / 66308   5 / 96846 1 / 107249 1 / 66308 0 / 214987
lung 5 / 128150 4 / 170663 1 / 159917 1 / 159059 5 / 128150 4 / 170663 1 / 159917 1 / 159059
lymph node 1 / 62650   99 / 5278419 13 / 4863489 1 / 62650 0 / 27007 99 / 5278419 13 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 7 / 46553 5 / 104307 422 / 43166038 624 / 30312656 7 / 46553 5 / 104307 422 / 43166038 624 / 30312656
muscle       1 / 61270 0 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 1 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 2 / 11462       2 / 11462 0 / 89988 0 / 94887 0 / 179472
pancreas         0 / 7237 0 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet 11 / 96524   -- -- 11 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 23 / 241088   4 / 207348 -- 23 / 241088 0 / 39531 4 / 207348 --
pooled tissue 19 / 276455   -- -- 19 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 8 / 79993 1 / 107080 1 / 266949 5 / 491794 8 / 79993 1 / 107080 1 / 266949 5 / 491794
retina   -- 12 / 820326 2 / 88490 0 / 29438 -- 12 / 820326 2 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin   2 / 125377 141 / 26905847 310 / 34522313 0 / 73633 2 / 125377 141 / 26905847 310 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 21 / 6230144 -- -- -- 21 / 6230144 --
stomach   1 / 65644   8 / 448716 0 / 26641 1 / 65644 0 / 124767 8 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 43 / 143630 3 / 100058 -- 100 / 12372003 43 / 143630 3 / 100058 -- 100 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     5 / 115938 4 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 5 / 115938 4 / 124664
uncharacterized tissue 35 / 207932 18 / 479819     35 / 207932 18 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus   5 / 133582 65 / 10193077 -- 0 / 38063 5 / 133582 65 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 149 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 149 / 13135050 --
white blood cells -- -- 27 / 846268 -- -- -- 27 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --