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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.19673Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 213 / 3316537 273 / 2498449 10323 / 114162531 2227 / 109592465 213 / 3316537 273 / 2498449 10323 / 114162531 2227 / 109592465
adrenal cortex -- 3 / 9928 -- -- -- 3 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   5 / 57865 -- 6 / 83577 0 / 16077 5 / 57865 -- 6 / 83577
bone marrow 1 / 14774   14 / 5047110 6 / 4978364 1 / 14774 0 / 29891 14 / 5047110 6 / 4978364
brain 19 / 506301 12 / 200215 50 / 729526 240 / 4997811 19 / 506301 12 / 200215 50 / 729526 240 / 4997811
cartilage   9 / 37226 -- 57 / 778035 0 / 15965 9 / 37226 -- 57 / 778035
cerebellum 2 / 90353   2 / 90885 29 / 1495938 2 / 90353 0 / 0 2 / 90885 29 / 1495938
cerebrum 4 / 198932   -- -- 4 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix 1 / 3888 14 / 44577 -- -- 1 / 3888 14 / 44577 -- --
colon   15 / 151167 6 / 98089 88 / 643586 0 / 26551 15 / 151167 6 / 98089 88 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 16 / 246043   -- -- 16 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine   1 / 2857 -- -- 0 / 19564 1 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 20 / 128826   8 / 85898 243 / 12434232 20 / 128826 0 / 46440 8 / 85898 243 / 12434232
gastrointestinal tract   3 / 12721   -- 0 / 28803 3 / 12721 0 / 45908 --
heart 8 / 76442   3 / 83063 -- 8 / 76442 0 / 1 3 / 83063 --
kidney 6 / 106627 12 / 89898 16 / 155372 17 / 100281 6 / 106627 12 / 89898 16 / 155372 17 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 2 / 96846 2 / 107249   4 / 214987 2 / 96846 2 / 107249 0 / 66308 4 / 214987
lung 4 / 128150 24 / 170663 9 / 159917 11 / 159059 4 / 128150 24 / 170663 9 / 159917 11 / 159059
lymph node 5 / 62650 4 / 27007 420 / 5278419 7 / 4863489 5 / 62650 4 / 27007 420 / 5278419 7 / 4863489
lymphoreticular 9 / 17836 6 / 44303 -- -- 9 / 17836 6 / 44303 -- --
mammary gland 4 / 46553 13 / 104307 8245 / 43166038 773 / 30312656 4 / 46553 13 / 104307 8245 / 43166038 773 / 30312656
muscle 5 / 74039 8 / 27691 15 / 107836 7 / 61270 5 / 74039 8 / 27691 15 / 107836 7 / 61270
nervous 4 / 10333   -- -- 4 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   28 / 89988 2 / 94887 5 / 179472 0 / 11462 28 / 89988 2 / 94887 5 / 179472
pancreas   16 / 74930 14 / 85728 11 / 189999 0 / 7237 16 / 74930 14 / 85728 11 / 189999
pancreatic islet 6 / 96524   -- -- 6 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   2 / 20557 -- -- 0 / 24 2 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 20 / 241088 7 / 39531 2 / 207348 -- 20 / 241088 7 / 39531 2 / 207348 --
pooled tissue 34 / 276455   -- -- 34 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 9 / 79993 4 / 107080 9 / 266949 20 / 491794 9 / 79993 4 / 107080 9 / 266949 20 / 491794
retina 1 / 29438 -- 21 / 820326 2 / 88490 1 / 29438 -- 21 / 820326 2 / 88490
salivary gland   3 / 10368 -- -- 0 / 2490 3 / 10368 -- --
skin 11 / 73633 18 / 125377 434 / 26905847 411 / 34522313 11 / 73633 18 / 125377 434 / 26905847 411 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 184 / 6230144 -- -- -- 184 / 6230144 --
stomach   6 / 65644   14 / 448716 0 / 26641 6 / 65644 0 / 124767 14 / 448716
synovium   3 / 1650 -- -- 0 / 249 3 / 1650 -- --
testis 6 / 143630   -- 275 / 12372003 6 / 143630 0 / 100058 -- 275 / 12372003
thymus 1 / 4478   -- -- 1 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   2 / 32606 3 / 115938 1 / 124664 0 / 11737 2 / 32606 3 / 115938 1 / 124664
uncharacterized tissue 8 / 207932 40 / 479819 1 / 21833   8 / 207932 40 / 479819 1 / 21833 0 / 51729
uterus 2 / 38063 13 / 133582 431 / 10193077 -- 2 / 38063 13 / 133582 431 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 367 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 367 / 13135050 --
white blood cells -- -- 67 / 846268 -- -- -- 67 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --