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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.190544Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 193 / 3316537 85 / 2498449 1007 / 114162531 771 / 109592465 193 / 3316537 85 / 2498449 1007 / 114162531 771 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 2 / 16077 3 / 57865 --   2 / 16077 3 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 2 / 14774 1 / 29891 11 / 5047110 9 / 4978364 2 / 14774 1 / 29891 11 / 5047110 9 / 4978364
brain 57 / 506301 6 / 200215 19 / 729526 95 / 4997811 57 / 506301 6 / 200215 19 / 729526 95 / 4997811
cartilage 2 / 15965   -- 2 / 778035 2 / 15965 0 / 37226 -- 2 / 778035
cerebellum 8 / 90353   4 / 90885 57 / 1495938 8 / 90353 0 / 0 4 / 90885 57 / 1495938
cerebrum 31 / 198932   -- -- 31 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon 1 / 26551 1 / 151167   2 / 643586 1 / 26551 1 / 151167 0 / 98089 2 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 11 / 246043   -- -- 11 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 3 / 128826 1 / 46440 2 / 85898 47 / 12434232 3 / 128826 1 / 46440 2 / 85898 47 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 1 / 76442   1 / 83063 -- 1 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 2 / 106627 6 / 89898 1 / 155372   2 / 106627 6 / 89898 1 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 1 / 96846 5 / 107249 1 / 66308 4 / 214987 1 / 96846 5 / 107249 1 / 66308 4 / 214987
lung 1 / 128150 4 / 170663 5 / 159917 1 / 159059 1 / 128150 4 / 170663 5 / 159917 1 / 159059
lymph node 8 / 62650 4 / 27007 582 / 5278419 102 / 4863489 8 / 62650 4 / 27007 582 / 5278419 102 / 4863489
lymphoreticular 1 / 17836 4 / 44303 -- -- 1 / 17836 4 / 44303 -- --
mammary gland 3 / 46553 2 / 104307 4 / 43166038 250 / 30312656 3 / 46553 2 / 104307 4 / 43166038 250 / 30312656
muscle 7 / 74039       7 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   2 / 89988   3 / 179472 0 / 11462 2 / 89988 0 / 94887 3 / 179472
pancreas   1 / 74930 1 / 85728   0 / 7237 1 / 74930 1 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet 2 / 96524 5 / 30072 -- -- 2 / 96524 5 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 9 / 241088   5 / 207348 -- 9 / 241088 0 / 39531 5 / 207348 --
pooled tissue 21 / 276455   -- -- 21 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 1 / 79993   3 / 266949 4 / 491794 1 / 79993 0 / 107080 3 / 266949 4 / 491794
retina   -- 44 / 820326 1 / 88490 0 / 29438 -- 44 / 820326 1 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 2 / 73633 4 / 125377 163 / 26905847 120 / 34522313 2 / 73633 4 / 125377 163 / 26905847 120 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 12 / 6230144 -- -- -- 12 / 6230144 --
stomach   1 / 65644 2 / 124767 14 / 448716 0 / 26641 1 / 65644 2 / 124767 14 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 3 / 143630 2 / 100058 -- 54 / 12372003 3 / 143630 2 / 100058 -- 54 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   3 / 32606 6 / 115938 6 / 124664 0 / 11737 3 / 32606 6 / 115938 6 / 124664
uncharacterized tissue 5 / 207932 27 / 479819     5 / 207932 27 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus 1 / 38063 1 / 133582 35 / 10193077 -- 1 / 38063 1 / 133582 35 / 10193077 --
vascular 2 / 46250 -- 97 / 13135050 -- 2 / 46250 -- 97 / 13135050 --
white blood cells -- -- 9 / 846268 -- -- -- 9 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --