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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.189782Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 83 / 3316537 56 / 2498449 702 / 114162531 1083 / 109592465 83 / 3316537 56 / 2498449 702 / 114162531 1083 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   2 / 57865 --   0 / 16077 2 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 1 / 14774   1 / 5047110 15 / 4978364 1 / 14774 0 / 29891 1 / 5047110 15 / 4978364
brain 12 / 506301 4 / 200215 17 / 729526 41 / 4997811 12 / 506301 4 / 200215 17 / 729526 41 / 4997811
cartilage     -- 3 / 778035 0 / 15965 0 / 37226 -- 3 / 778035
cerebellum 1 / 90353   2 / 90885 28 / 1495938 1 / 90353 0 / 0 2 / 90885 28 / 1495938
cerebrum 4 / 198932   -- -- 4 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   2 / 44577 -- -- 0 / 3888 2 / 44577 -- --
colon   4 / 151167   4 / 643586 0 / 26551 4 / 151167 0 / 98089 4 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 4 / 246043   -- -- 4 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 6 / 128826   2 / 85898 273 / 12434232 6 / 128826 0 / 46440 2 / 85898 273 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803     -- 1 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart 2 / 76442     -- 2 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 2 / 106627 2 / 89898     2 / 106627 2 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 1 / 96846 4 / 107249   2 / 214987 1 / 96846 4 / 107249 0 / 66308 2 / 214987
lung 5 / 128150 9 / 170663     5 / 128150 9 / 170663 0 / 159917 0 / 159059
lymph node 1 / 62650 1 / 27007 66 / 5278419 6 / 4863489 1 / 62650 1 / 27007 66 / 5278419 6 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 1 / 46553 5 / 104307 120 / 43166038 272 / 30312656 1 / 46553 5 / 104307 120 / 43166038 272 / 30312656
muscle 2 / 74039       2 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary         0 / 11462 0 / 89988 0 / 94887 0 / 179472
pancreas   1 / 74930   1 / 189999 0 / 7237 1 / 74930 0 / 85728 1 / 189999
pancreatic islet 1 / 96524   -- -- 1 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 5 / 241088   1 / 207348 -- 5 / 241088 0 / 39531 1 / 207348 --
pooled tissue 20 / 276455   -- -- 20 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 1 / 79993 1 / 107080   4 / 491794 1 / 79993 1 / 107080 0 / 266949 4 / 491794
retina 3 / 29438 -- 8 / 820326 3 / 88490 3 / 29438 -- 8 / 820326 3 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 1 / 73633 2 / 125377 143 / 26905847 334 / 34522313 1 / 73633 2 / 125377 143 / 26905847 334 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 11 / 6230144 -- -- -- 11 / 6230144 --
stomach       3 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 3 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 5 / 143630 5 / 100058 -- 91 / 12372003 5 / 143630 5 / 100058 -- 91 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     2 / 115938 1 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 2 / 115938 1 / 124664
uncharacterized tissue 3 / 207932 12 / 479819   2 / 51729 3 / 207932 12 / 479819 0 / 21833 2 / 51729
uterus   1 / 133582 257 / 10193077 -- 0 / 38063 1 / 133582 257 / 10193077 --
vascular   -- 70 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 70 / 13135050 --
white blood cells -- -- 2 / 846268 -- -- -- 2 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --