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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.189075Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 235 / 3316537 193 / 2498449 3099 / 114162531 3816 / 109592465 235 / 3316537 193 / 2498449 3099 / 114162531 3816 / 109592465
adrenal cortex -- 2 / 9928 -- -- -- 2 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone 4 / 16077 5 / 57865 --   4 / 16077 5 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow 1 / 14774   65 / 5047110 52 / 4978364 1 / 14774 0 / 29891 65 / 5047110 52 / 4978364
brain 23 / 506301 6 / 200215 49 / 729526 578 / 4997811 23 / 506301 6 / 200215 49 / 729526 578 / 4997811
cartilage   2 / 37226 -- 71 / 778035 0 / 15965 2 / 37226 -- 71 / 778035
cerebellum     3 / 90885 109 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 3 / 90885 109 / 1495938
cerebrum 1 / 198932   -- -- 1 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   3 / 44577 -- -- 0 / 3888 3 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 14 / 151167 4 / 98089 34 / 643586 2 / 26551 14 / 151167 4 / 98089 34 / 643586
ear 1 / 16130 -- -- -- 1 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 8 / 246043   -- -- 8 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   3 / 17290 -- -- 0 / 270 3 / 17290 -- --
eye 5 / 128826   3 / 85898 108 / 12434232 5 / 128826 0 / 46440 3 / 85898 108 / 12434232
gastrointestinal tract 1 / 28803 1 / 12721 2 / 45908 -- 1 / 28803 1 / 12721 2 / 45908 --
heart 3 / 76442   3 / 83063 -- 3 / 76442 0 / 1 3 / 83063 --
kidney 16 / 106627 13 / 89898 5 / 155372 1 / 100281 16 / 106627 13 / 89898 5 / 155372 1 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 5 / 96846 8 / 107249 8 / 66308 19 / 214987 5 / 96846 8 / 107249 8 / 66308 19 / 214987
lung 8 / 128150 11 / 170663 9 / 159917 17 / 159059 8 / 128150 11 / 170663 9 / 159917 17 / 159059
lymph node 12 / 62650 6 / 27007 206 / 5278419 67 / 4863489 12 / 62650 6 / 27007 206 / 5278419 67 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland 5 / 46553 7 / 104307 1417 / 43166038 1146 / 30312656 5 / 46553 7 / 104307 1417 / 43166038 1146 / 30312656
muscle 4 / 74039   1 / 107836 4 / 61270 4 / 74039 0 / 27691 1 / 107836 4 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 2 / 11462 9 / 89988 17 / 94887 12 / 179472 2 / 11462 9 / 89988 17 / 94887 12 / 179472
pancreas   2 / 74930 7 / 85728 12 / 189999 0 / 7237 2 / 74930 7 / 85728 12 / 189999
pancreatic islet 18 / 96524 1 / 30072 -- -- 18 / 96524 1 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland 1 / 13260   -- -- 1 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 25 / 241088 2 / 39531 31 / 207348 -- 25 / 241088 2 / 39531 31 / 207348 --
pooled tissue 17 / 276455   -- -- 17 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 7 / 79993 27 / 107080 11 / 266949 22 / 491794 7 / 79993 27 / 107080 11 / 266949 22 / 491794
retina 2 / 29438 -- 55 / 820326 7 / 88490 2 / 29438 -- 55 / 820326 7 / 88490
salivary gland     -- -- 0 / 2490 0 / 10368 -- --
skin 12 / 73633 8 / 125377 336 / 26905847 1175 / 34522313 12 / 73633 8 / 125377 336 / 26905847 1175 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 1 / 52939   -- -- 1 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 102 / 6230144 -- -- -- 102 / 6230144 --
stomach   9 / 65644 6 / 124767 69 / 448716 0 / 26641 9 / 65644 6 / 124767 69 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 23 / 143630 4 / 100058 -- 277 / 12372003 23 / 143630 4 / 100058 -- 277 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   2 / 32606 14 / 115938 30 / 124664 0 / 11737 2 / 32606 14 / 115938 30 / 124664
uncharacterized tissue 4 / 207932 33 / 479819 2 / 21833 6 / 51729 4 / 207932 33 / 479819 2 / 21833 6 / 51729
uterus 13 / 38063 14 / 133582 516 / 10193077 -- 13 / 38063 14 / 133582 516 / 10193077 --
vascular 8 / 46250 -- 210 / 13135050 -- 8 / 46250 -- 210 / 13135050 --
white blood cells -- -- 17 / 846268 -- -- -- 17 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --