Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.188456Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 99 / 3316537 91 / 2498449 1689 / 114162531 2877 / 109592465 99 / 3316537 91 / 2498449 1689 / 114162531 2877 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   4 / 57865 -- 1 / 83577 0 / 16077 4 / 57865 -- 1 / 83577
bone marrow 2 / 14774 3 / 29891 18 / 5047110 14 / 4978364 2 / 14774 3 / 29891 18 / 5047110 14 / 4978364
brain 9 / 506301 6 / 200215 8 / 729526 94 / 4997811 9 / 506301 6 / 200215 8 / 729526 94 / 4997811
cartilage   1 / 37226 -- 15 / 778035 0 / 15965 1 / 37226 -- 15 / 778035
cerebellum     1 / 90885 33 / 1495938 0 / 90353 0 / 0 1 / 90885 33 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   1 / 44577 -- -- 0 / 3888 1 / 44577 -- --
colon   2 / 151167 1 / 98089 4 / 643586 0 / 26551 2 / 151167 1 / 98089 4 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 6 / 246043   -- -- 6 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 2 / 128826   2 / 85898 440 / 12434232 2 / 128826 0 / 46440 2 / 85898 440 / 12434232
gastrointestinal tract   1 / 12721   -- 0 / 28803 1 / 12721 0 / 45908 --
heart 4 / 76442   2 / 83063 -- 4 / 76442 0 / 1 2 / 83063 --
kidney 5 / 106627 4 / 89898 1 / 155372 3 / 100281 5 / 106627 4 / 89898 1 / 155372 3 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 3 / 96846 1 / 107249 2 / 66308 3 / 214987 3 / 96846 1 / 107249 2 / 66308 3 / 214987
lung 3 / 128150 13 / 170663 1 / 159917 1 / 159059 3 / 128150 13 / 170663 1 / 159917 1 / 159059
lymph node 1 / 62650 1 / 27007 164 / 5278419 75 / 4863489 1 / 62650 1 / 27007 164 / 5278419 75 / 4863489
lymphoreticular 1 / 17836 1 / 44303 -- -- 1 / 17836 1 / 44303 -- --
mammary gland 2 / 46553 8 / 104307 101 / 43166038 1159 / 30312656 2 / 46553 8 / 104307 101 / 43166038 1159 / 30312656
muscle 2 / 74039     2 / 61270 2 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 2 / 61270
nervous 2 / 10333   -- -- 2 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 1 / 11462 7 / 89988 2 / 94887 7 / 179472 1 / 11462 7 / 89988 2 / 94887 7 / 179472
pancreas   2 / 74930 1 / 85728 3 / 189999 0 / 7237 2 / 74930 1 / 85728 3 / 189999
pancreatic islet 3 / 96524   -- -- 3 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   1 / 20557 -- -- 0 / 24 1 / 20557 -- --
peripheral nervous system     -- -- 0 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 12 / 241088   6 / 207348 -- 12 / 241088 0 / 39531 6 / 207348 --
pooled tissue 20 / 276455   -- -- 20 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 7 / 79993 2 / 107080 8 / 266949 7 / 491794 7 / 79993 2 / 107080 8 / 266949 7 / 491794
retina   -- 12 / 820326 4 / 88490 0 / 29438 -- 12 / 820326 4 / 88490
salivary gland   1 / 10368 -- -- 0 / 2490 1 / 10368 -- --
skin 3 / 73633 7 / 125377 762 / 26905847 740 / 34522313 3 / 73633 7 / 125377 762 / 26905847 740 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 87 / 6230144 -- -- -- 87 / 6230144 --
stomach 1 / 26641 4 / 65644 4 / 124767 10 / 448716 1 / 26641 4 / 65644 4 / 124767 10 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 2 / 143630 2 / 100058 -- 254 / 12372003 2 / 143630 2 / 100058 -- 254 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid     1 / 115938 6 / 124664 0 / 11737 0 / 32606 1 / 115938 6 / 124664
uncharacterized tissue 3 / 207932 15 / 479819   2 / 51729 3 / 207932 15 / 479819 0 / 21833 2 / 51729
uterus 2 / 38063 4 / 133582 274 / 10193077 -- 2 / 38063 4 / 133582 274 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 216 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 216 / 13135050 --
white blood cells -- -- 15 / 846268 -- -- -- 15 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --