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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.180062Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 216 / 3316537 311 / 2498449 3512 / 114162531 4683 / 109592465 216 / 3316537 311 / 2498449 3512 / 114162531 4683 / 109592465
adrenal cortex -- 1 / 9928 -- -- -- 1 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone   4 / 57865 -- 16 / 83577 0 / 16077 4 / 57865 -- 16 / 83577
bone marrow   1 / 29891 622 / 5047110 291 / 4978364 0 / 14774 1 / 29891 622 / 5047110 291 / 4978364
brain 7 / 506301 13 / 200215 16 / 729526 178 / 4997811 7 / 506301 13 / 200215 16 / 729526 178 / 4997811
cartilage   3 / 37226 -- 80 / 778035 0 / 15965 3 / 37226 -- 80 / 778035
cerebellum 2 / 90353   1 / 90885 2 / 1495938 2 / 90353 0 / 0 1 / 90885 2 / 1495938
cerebrum     -- -- 0 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix   7 / 44577 -- -- 0 / 3888 7 / 44577 -- --
colon 2 / 26551 41 / 151167 5 / 98089 14 / 643586 2 / 26551 41 / 151167 5 / 98089 14 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 6 / 246043   -- -- 6 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus   1 / 17290 -- -- 0 / 270 1 / 17290 -- --
eye 6 / 128826   4 / 85898 296 / 12434232 6 / 128826 0 / 46440 4 / 85898 296 / 12434232
gastrointestinal tract 4 / 28803   2 / 45908 -- 4 / 28803 0 / 12721 2 / 45908 --
heart 2 / 76442   1 / 83063 -- 2 / 76442 0 / 1 1 / 83063 --
kidney 10 / 106627 12 / 89898 4 / 155372 4 / 100281 10 / 106627 12 / 89898 4 / 155372 4 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 5 / 96846 9 / 107249 1 / 66308 7 / 214987 5 / 96846 9 / 107249 1 / 66308 7 / 214987
lung 14 / 128150 16 / 170663 3 / 159917 16 / 159059 14 / 128150 16 / 170663 3 / 159917 16 / 159059
lymph node 1 / 62650 24 / 27007 171 / 5278419 241 / 4863489 1 / 62650 24 / 27007 171 / 5278419 241 / 4863489
lymphoreticular 4 / 17836 11 / 44303 -- -- 4 / 17836 11 / 44303 -- --
mammary gland   22 / 104307 790 / 43166038 1706 / 30312656 0 / 46553 22 / 104307 790 / 43166038 1706 / 30312656
muscle       2 / 61270 0 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 2 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary 2 / 11462 4 / 89988 5 / 94887 12 / 179472 2 / 11462 4 / 89988 5 / 94887 12 / 179472
pancreas   16 / 74930   21 / 189999 0 / 7237 16 / 74930 0 / 85728 21 / 189999
pancreatic islet 8 / 96524   -- -- 8 / 96524 0 / 30072 -- --
parathyroid   3 / 20557 -- -- 0 / 24 3 / 20557 -- --
peripheral nervous system 1 / 14891   -- -- 1 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 6170 -- -- --
pituitary gland     -- -- 0 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta 8 / 241088   2 / 207348 -- 8 / 241088 0 / 39531 2 / 207348 --
pooled tissue 33 / 276455   -- -- 33 / 276455 0 / 0 -- --
prostate 16 / 79993 2 / 107080 8 / 266949 12 / 491794 16 / 79993 2 / 107080 8 / 266949 12 / 491794
retina   -- 6 / 820326   0 / 29438 -- 6 / 820326 0 / 88490
salivary gland   11 / 10368 -- -- 0 / 2490 11 / 10368 -- --
skin 5 / 73633 15 / 125377 912 / 26905847 1728 / 34522313 5 / 73633 15 / 125377 912 / 26905847 1728 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen 14 / 52939   -- -- 14 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 221 / 6230144 -- -- -- 221 / 6230144 --
stomach 3 / 26641 22 / 65644   27 / 448716 3 / 26641 22 / 65644 0 / 124767 27 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 2 / 143630   -- 27 / 12372003 2 / 143630 0 / 100058 -- 27 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid 2 / 11737 1 / 32606 6 / 115938 2 / 124664 2 / 11737 1 / 32606 6 / 115938 2 / 124664
uncharacterized tissue 58 / 207932 50 / 479819   1 / 51729 58 / 207932 50 / 479819 0 / 21833 1 / 51729
uterus   22 / 133582 186 / 10193077 -- 0 / 38063 22 / 133582 186 / 10193077 --
vascular 1 / 46250 -- 414 / 13135050 -- 1 / 46250 -- 414 / 13135050 --
white blood cells -- -- 132 / 846268 -- -- -- 132 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --