Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Hs.17860Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 307 / 3316537 53 / 2498449 132 / 114162531 267 / 109592465 307 / 3316537 53 / 2498449 132 / 114162531 267 / 109592465
adrenal cortex --   -- -- -- 0 / 9928 -- --
adrenal medulla --   -- -- -- 0 / 247 -- --
bone     --   0 / 16077 0 / 57865 -- 0 / 83577
bone marrow         0 / 14774 0 / 29891 0 / 5047110 0 / 4978364
brain 100 / 506301 5 / 200215 20 / 729526 65 / 4997811 100 / 506301 5 / 200215 20 / 729526 65 / 4997811
cartilage     --   0 / 15965 0 / 37226 -- 0 / 778035
cerebellum 68 / 90353   3 / 90885 15 / 1495938 68 / 90353 0 / 0 3 / 90885 15 / 1495938
cerebrum 91 / 198932   -- -- 91 / 198932 0 / 3422 -- --
cervix     -- -- 0 / 3888 0 / 44577 -- --
colon     1 / 98089   0 / 26551 0 / 151167 1 / 98089 0 / 643586
ear   -- -- -- 0 / 16130 -- -- --
embryonic tissue 4 / 246043   -- -- 4 / 246043 0 / 38 -- --
endocrine     -- -- 0 / 19564 0 / 2857 -- --
esophagus     -- -- 0 / 270 0 / 17290 -- --
eye 9 / 128826 1 / 46440   38 / 12434232 9 / 128826 1 / 46440 0 / 85898 38 / 12434232
gastrointestinal tract       -- 0 / 28803 0 / 12721 0 / 45908 --
heart       -- 0 / 76442 0 / 1 0 / 83063 --
kidney 16 / 106627 8 / 89898     16 / 106627 8 / 89898 0 / 155372 0 / 100281
limb -- -- -- -- -- -- -- --
liver 1 / 96846   5 / 66308   1 / 96846 0 / 107249 5 / 66308 0 / 214987
lung   3 / 170663     0 / 128150 3 / 170663 0 / 159917 0 / 159059
lymph node     1 / 5278419 14 / 4863489 0 / 62650 0 / 27007 1 / 5278419 14 / 4863489
lymphoreticular     -- -- 0 / 17836 0 / 44303 -- --
mammary gland     20 / 43166038 42 / 30312656 0 / 46553 0 / 104307 20 / 43166038 42 / 30312656
muscle 1 / 74039       1 / 74039 0 / 27691 0 / 107836 0 / 61270
nervous     -- -- 0 / 10333 0 / 8 -- --
ovary   1 / 89988   3 / 179472 0 / 11462 1 / 89988 0 / 94887 3 / 179472
pancreas         0 / 7237 0 / 74930 0 / 85728 0 / 189999
pancreatic islet   13 / 30072 -- -- 0 / 96524 13 / 30072 -- --
parathyroid     -- -- 0 / 24 0 / 20557 -- --
peripheral nervous system 2 / 14891   -- -- 2 / 14891 0 / 645 -- --
pineal gland 1 / 6170 -- -- -- 1 / 6170 -- -- --
pituitary gland 2 / 13260   -- -- 2 / 13260 0 / 1358 -- --
placenta       -- 0 / 241088 0 / 39531 0 / 207348 --
pooled tissue 6 / 276455   -- -- 6 / 276455 0 / 0 -- --
prostate     2 / 266949 3 / 491794 0 / 79993 0 / 107080 2 / 266949 3 / 491794
retina 1 / 29438 -- 41 / 820326 1 / 88490 1 / 29438 -- 41 / 820326 1 / 88490
salivary gland 1 / 2490   -- -- 1 / 2490 0 / 10368 -- --
skin     4 / 26905847 8 / 34522313 0 / 73633 0 / 125377 4 / 26905847 8 / 34522313
soft tissue --   -- -- -- 0 / 3 -- --
spleen     -- -- 0 / 52939 0 / 5 -- --
stem cell -- -- 15 / 6230144 -- -- -- 15 / 6230144 --
stomach       1 / 448716 0 / 26641 0 / 65644 0 / 124767 1 / 448716
synovium     -- -- 0 / 249 0 / 1650 -- --
testis 2 / 143630 5 / 100058 -- 66 / 12372003 2 / 143630 5 / 100058 -- 66 / 12372003
thymus     -- -- 0 / 4478 0 / 165 -- --
thyroid   2 / 32606 3 / 115938 11 / 124664 0 / 11737 2 / 32606 3 / 115938 11 / 124664
uncharacterized tissue 2 / 207932 11 / 479819     2 / 207932 11 / 479819 0 / 21833 0 / 51729
uterus   4 / 133582 9 / 10193077 -- 0 / 38063 4 / 133582 9 / 10193077 --
vascular   -- 3 / 13135050 -- 0 / 46250 -- 3 / 13135050 --
white blood cells -- -- 5 / 846268 -- -- -- 5 / 846268 --
whole body -- -- -- -- -- -- -- --